R中“错误：包'_____'是在3.0.0之前构建的：请重新安装”的原因

Question

在一台运行 R 2.15.2 的计算机上，我从 .zip 文件安装了软件包（这些软件包碰巧是ggplot2和data.table ，但我不认为特定的软件包是我的问题。）一切正常。 我将这些软件包带到没有互联网连接的计算机上并安装它们。 另一台计算机正在运行 R 3.0.1。 这些软件包似乎安装没有问题（使用 R 的“从本地 zip 文件安装软件包”选项）。 当我使用library()调用包时，出现以下错误：

Error: package '<insert name of newly installed package here>' was build before 3.0.0: please-re-install it

任何人都可以解释引发此错误的潜在原因吗？ .zip 包是否必须位于特定目录中才能正确安装？ 如果 R 安装在加载 .zip 包的单独分区上，这会导致错误吗？

我不知所措，任何指针都非常感谢。 这是一个很难复制的； 如果您需要任何其他版本/系统参数来了解问题，请随时提出。

Answer 1

我在查看GitHub ggplot2 问题 #796 时找到了这个解决方案

update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)

它将更新所有需要重新安装的软件包。

Answer 2

运行install.packages("codetools")可以解决 R 3.0.2 的这个问题，如果你有和我一样的问题：

installing to /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/libs
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
Error : package ‘**codetools**’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : unable to load R code in package ‘Rcpp’
ERROR: lazy loading failed for package ‘Rcpp’

Answer 3

我根据https://github.com/rstudio/shiny-server/wiki/Ubuntu-step-by-step-install-instructions安装了闪亮的

并在步骤中得到相同的错误

sudo su - -c "R -e \"install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')\""

Warning messages:
1: In install.packages("shiny", repos = "http://cran.rstudio.com/") :
 installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status
2: In install.packages("shiny", repos = "http://cran.rstudio.com/") :
 installation of package ‘httpuv’ had non-zero exit status
3: In install.packages("shiny", repos = "http://cran.rstudio.com/") :
 installation of package ‘shiny’ had non-zero exit status

我通过启动 R 尝试了 Richard Lee 的答案

R

并得到错误

Warning in install.packages("shiny") :
'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable
Would you like to use a personal library instead?  (y/n) n
Error in install.packages("shiny") : unable to install packages

显然没有写权限，所以

sudo R

现在我又试了一次

install.packages("shiny")

并得到了一些错误

Error : package ‘codetools’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : package ‘RJSONIO’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : package ‘caTools’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : package ‘bitops’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : package ‘digest’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : package ‘xtable’ was built before R 3.0.0: please re-install it

每次出现错误时，我都会重新安装请求的包

install.packages("codetools")
install.packages("RJSONIO")
etc.

最终，我能够安装 Rccp、httpuv，甚至是 Shiny。 现在它起作用了！！

另请参阅R version 3.0.2 "Frisbee Sailing" 上的 Shiny 软件包安装

Answer 4

我正在使用rkward精确

我在使用rkward 时遇到了类似的错误。 具体这个：

'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable

我临时更改了此目录的权限，以便rkward可以从其控制台运行它：

 update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)

全部解决这个问题：

Error: package '' was build before 3.0.0: please-re-install it

这样（叹气......）我可以精确地修复音频的“默认”配置。 我不能在rkward 中使用play()等。

只需要phonon-backend-gtstreamer

Answer 5

这是我使用的解决方法：

我在一台可以上网的电脑上安装了最新版本的 R。 然后我加载了我需要的包（包->安装包->选择镜像->选择包...

R 安装完成后，它会显示一条消息，说明临时 .zip 包所在的位置。 我导航到这个位置，获取临时包，并将其刻录到 CD。

通过这种方式，我可以在没有互联网访问的情况下将较新的软件包构建到计算机上。 我仍然很想知道是否有一种简单的方法可以重建在早期 R 版本上下载的软件包，使其与最新版本兼容（无需互联网连接）。

感谢您为我指明正确的方向 @JoshuaUlrich

Answer 6

我尝试在 ubuntu 12.04LTS 上的 R(v3.1.0) 上安装 swirl：

sudo R
install.packages("swirl")

但是遇到了类似的错误：

错误：包“codetools”是在 R 3.0.0 之前构建的：请重新安装 错误：无法在包“httr”中加载 R 代码错误：包“httr”的延迟加载失败 * 删除“/usr/local/lib” /R/site-library/httr' 错误：依赖项 'testthat'、'httr' 不可用于包 'swirl' * 删除 '/usr/local/lib/R/site-library/swirl'

做以下帮助我：

install.packages('codetools')
install.packages("swirl")
library("swirl")
swirl()

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我希望同样可以帮助解决您的安装问题。