PyFITS：文件已存在

Question

我真的很接近完成一个大代码，但它的最后一部分似乎失败了，我不知道为什么。 我在这里尝试做的是获取一个图像数组，将其与不同的图像数组进行比较，并且无论初始图像数组等于 1，我都想在第二个图像数组中屏蔽该部分。 但是，我收到一个奇怪的错误：

代码：

maskimg='omask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits'
newmaskimg=pf.getdata(maskimg)
oimg=pf.getdata(inimgs)
for i in range (newmaskimg.shape[0]):
    for j in range (newmaskimg.shape[1]):
        if newmaskimg[i,j]==1:
            oimg[i,j]=0
pf.writeto('newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits',newmaskimg)

错误：

/home/vidur/se_files/fetch_swarp10.py in objmask(inimgs, inwhts, thresh1, thresh2, tfdel, xceng, yceng, outdir, tmpdir)
    122             if newmaskimg[i,j]==1:
    123                 oimg[i,j]=0
--> 124     pf.writeto('newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits',newmaskimg)
    125 
    126 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/convenience.pyc in writeto(filename, data, header, output_verify, clobber, checksum)
    396         hdu = PrimaryHDU(data, header=header)
    397     hdu.writeto(filename, clobber=clobber, output_verify=output_verify,
--> 398                 checksum=checksum)
    399 
    400 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/base.pyc in writeto(self, name, output_verify, clobber, checksum)
    348         hdulist = HDUList([self])
    349         hdulist.writeto(name, output_verify, clobber=clobber,
--> 350                         checksum=checksum)
    351 
    352     def _get_raw_data(self, shape, code, offset):

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/hdulist.pyc in writeto(self, fileobj, output_verify, clobber, checksum)
    651                     os.remove(filename)
    652                 else:
--> 653                     raise IOError("File '%s' already exists." % filename)
    654         elif (hasattr(fileobj, 'len') and fileobj.len > 0):
    655             if clobber:

IOError: File 'newestmaskPHOTOf105w0.fits' already exists.

Answer 1

如果你不关心覆盖现有文件， pyfits.writeto接受一个clobber参数来自动覆盖现有文件（它仍然会输出警告）：

pyfits.writeto(..., clobber=True)

顺便说一句，让我非常强调您上面发布的代码非常不是使用 Numpy 的正确方法。 代码中的循环可以写在一行中，速度会快几个数量级。 例如，许多可能性之一是这样写：

oimg[newmaskimg == 1] = 0

Answer 2

是的，添加clobber = True 。 我以前在我的代码中使用过它，它工作得很好。 或者，只需去sudo rm path/to/file并删除它们，以便您可以再次运行它。

Answer 3

我遇到了同样的问题，结果证明使用参数clobber仍然有效，但在未来版本的 AstroPy 中将不受支持。

参数overwrite做同样的事情并且不会发出错误消息。