R heatmap.2键色

Question

我正在使用heatmap.2创建一个热图，并且对颜色键的比例有疑问。 我已将log10应用到我的数据，并且具有一些负值。 但是，颜色键在0到0.3之间缩放。 这个规模是从哪里来的？

library(gplots)
scalewhitered <- colorRampPalette(c("white", "red"), space = "rgb")(255)
heatmap.2(as.matrix(log10_normalised),Rowv=T, Colv=F,scale="none",     trace="none",labRow=rownames(log10_normalised), col=scalewhitered, xlab="", ylab="", mar=c(10,10))

是否可以将所有0值都设置为白色，然后将非零数字（包括负数）显示为不同的红色阴影？ 非常感谢。

Answer 1

这里的想法是创建自己的色标（基本上必须定义颜色范围）。 您可以从RColorBrewer包使用colorRampPalette：

http://cran.r-project.org/web/packages/RColorBrewer/

看一下下面的链接，他们找到了解决方法：

如何在R中更改heatmap.2颜色范围？