无法从Runtime.exec（）获得输出

Question

我已经编写了一个代码来通过Java在Shell上执行命令：

 String filename="/home/abhijeet/sample.txt";

        Process contigcount_p;

        String command_to_count="grep  \">\" "+filename+" | wc -l";

        System.out.println("command for counting contigs "+command_to_count); 

        contigcount_p=Runtime.getRuntime().exec(command_to_count);


         contigcount_p.wait();

由于使用了管道符号，所以我无法成功执行命令。根据我最后一个问题的讨论，我将变量包装在shell中：

Runtime.getRuntime().exec(new String[]{"sh", "-c", "grep \\">\\" "+filename+" | wc -l"});

它对我有用，因为它确实在shell上执行命令，但是仍然在我尝试使用缓冲阅读器读取其输出时：

   BufferedReader reader = 
                    new BufferedReader(new InputStreamReader(contigcount_p.getInputStream())); 

   String line=" ";
   while((line=reader.readLine())!=null)
   {
       output.append(line+"\n");
   }

它返回一个空值，正如我在上一个问题上讨论的那样，我找到了一个临时解决方案： link ，但是我想通过使用BufferedReader读取输出来使用正确的方法。

Answer 1

当我使用{"sh", "-c", "grep \\">\\" "+filename+" | wc -l"}的命令行时，它会继续覆盖我的文件

我必须更改它，以便双引号引起来， {"sh", "-c", "grep \\"\\">\\"\\" "+filename+" | wc -l"}

因此，使用它作为我的测试文件的内容...

>
>
>

Not a new line >

并使用此代码...

import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;

public class TestProcess {

    public static void main(String[] args) {
        String filename = "test.tx";
        String test = "grep \"\">\"\" "+filename+" | wc -l";
        System.out.println(test);

        try {
            ProcessBuilder pb = new ProcessBuilder("sh", "-c", test);
            pb.redirectError();
            Process p = pb.start();
            new Thread(new Consumer(p.getInputStream())).start();

            int ec = p.waitFor();
            System.out.println("ec: " + ec);
        } catch (IOException | InterruptedException exp) {
            exp.printStackTrace();
        }
    }

    public static class Consumer implements Runnable {

        private InputStream is;

        public Consumer(InputStream is) {
            this.is = is;
        }

        @Override
        public void run() {
            try (BufferedReader reader =  new BufferedReader(new InputStreamReader(is))){
                String value = null;
                while ((value = reader.readLine()) != null) {
                    System.out.println(value);
                }
            } catch (IOException exp) {
                exp.printStackTrace();
            }
        }

    }

}

我能够产生这个输出...

grep "">"" test.tx | wc -l
4
ec: 0

通常，在处理外部流程时，使用ProcessBuilder通常更容易，它具有一些不错的选项，包括重定向错误/ stdout和设置执行上下文目录...