在没有X11的情况下用开罗支持编译R.

Question

我正在尝试从启用cairo支持的源代码编译R 3.1.1。 我想要这个，因为我试图在没有图形环境的服务器上运行R（因此没有X11），但仍然输出PNG。

我试着用R配置

./configure --with-x=no --with-cairo=yes --with-libpng=yes --enable-R-shlib --prefix=$HOME

这样做会生成一个没有png或cairo支持的R二进制文件（如capabilities() ）。 在config.log ，有以下内容。

configure:31563: checking for X 
configure:31749: result: disabled
configure:32420: result: using X11 ... no
configure:32530: checking whether pkg-config knows about cairo and pango 
configure:32542: result: yes
configure:32576: checking whether cairo including pango is >= 1.2 and works 
configure:32599: gcc -std=gnu99 -o conftest -g -O2 -fpic  -I/usr/local/include  -pthread -I/home/rmccloskey/include/pango-1.0 -I/home/rmccloskey/include/cairo -I/home/rmccl
oskey/include/glib-2.0 -I/home/rmccloskey/lib/glib-2.0/include -I/home/rmccloskey/include/pixman-1 -I/usr/include/freetype2 -I/home/rmccloskey/include/freetype2 -I/home/rmc
closkey/include/libpng16   -L/usr/local/lib64 conftest.c -lrt -ldl -lm  -L/home/rmccloskey/lib -lpangocairo-1.0 -lpango-1.0 -lgobject-2.0 -lglib-2.0 -lpng16 -lz -lcairo   >
&5
conftest.c:232:24: fatal error: cairo-xlib.h: No such file or directory
 #include <cairo-xlib.h>
                        ^     
compilation terminated.

如您所见，configure知道cairo和pango，它也知道我没有使用X11。 但是它仍然试图编译一个需要cairo-xlib.h的文件？ 我能在这做什么？

Answer 1

我已经能够使用CentOS-6.5和R-3.1.2完成这项工作。 我不得不首先安装cairo和pango。 这是我的configure命令：

./configure --with-recommended-packages = no --without-x --with-cairo --with-libpng --with-libtiff --with-jpeglib --enable-R-shlib

Answer 2

从狭义上讲，开罗似乎需要x11标头。

从更广泛的意义上讲，查看详细介绍xvfb虚拟x11服务器使用的各种答案 - 它们允许您无头使用。

此外，您可以尝试在没有x11，png，cairo的情况下构建 - 然后使用CRAN的两个cairo包中的一个来创建图形。 在Debian / Ubuntu中，我们至少还为您预先构建了cairoDevice包。

Answer 3

我有一些确切的问题。 我用下面非常强硬的方式解决了这个问题。

在Rxyz src目录中，编辑配置文件。 有一条线：

#include <cairo-xlib.h>

我只是删除了这一行。 然后运行此文件并制作。 一切都适合我。 我的cairo编译时支持x11。 因为我在共享的RHEL6盒子上。 我做任何事都没有根。 我这样做的目的是让R与Jupyter笔记本一起工作。 除此之外，我还需要在$HOME/.Rprofile添加options(bitmapType='cairo') 。 此链接非常有用。

通过做所有这些黑客攻击，现在一切都适合我。 :)