重复绘制同一图-如何使节点处于相同位置？

Question

我正在使用NetworkX和Matplotlib在Python中工作。

当我一遍又一遍地绘制相同的图形但颜色不同时，如何使节点每次都处于相同的位置？ 现在我得到：

但是我将节点添加为字典的键，并将每个节点的颜色作为值，然后对字典进行排序，并将节点作为已排序的字典的键，并将颜色作为已排序dict的值。 相同的节点始终以相同的顺序添加。 我以为那行得通...

因此，其中x包含节点（分支）列表：

for ct2,i in enumerate(x):
        for ct,j in enumerate(i):
            vertex =  j[t] 

            if np.angle(j[t]) <0 or np.angle(j[t]) >= np.angle(cutoff):
                C[vertex] = 0.0
            else:
                C[vertex] = .8- 3*(np.angle(j[t])/np.angle(cutoff))
    COLORS =  collections.OrderedDict(sorted(C.items())) 

然后进行图形调用：

pos=nx.graphviz_layout(G,'dot')

nx.draw_networkx_nodes(
    G,pos,nodelist=COLORS.keys(),cmap=plt.get_cmap(cmap),
    node_size=nodesize,alpha=.6,vmax=1,vmin=0, node_color = COLORS.values() 
)

我究竟做错了什么？

Answer 1

最好查看图形调用相对于循环的位置（内部？外部？）。

但是看起来循环中有pos=nx.graphviz_layout(G,'dot') 。 因此，每次在循环中，它都会重新计算pos 。 这是告诉算法将节点放置在何处的变量。 该位置有些随机，因此每次调用都会将它们放置在不同的位置（对于spring_layout来说更明显）。

如果这是您要做的，请移动

pos=nx.graphviz_layout(G,'dot')

在循环之前。 这样就不会每次都重新生成。