将Pajek文件转换为CSV并在R Shiny中显示

Question

有谁知道如何闪亮地读取pajek文件，然后找到每个顶点的度并将其以降序输出到CSV文件？

这是我要导入的Pajek文件，并将度导出为CSV。

在R中，我知道通常如何这样编码：

#read the pajek file in igraph
reponetwork <- read.graph("network.net", format = "pajek")

#Inspect the data:
degree(reponetwork)
sort(degree(reponetwork), decreasing = TRUE)

但是我不确定如何在Shiny中执行此操作：

到目前为止，这是我所做的：

用户界面

shinyUI(fluidPage(
  titlePanel("Finding most influential vertex in a network"),

  sidebarLayout(
    sidebarPanel(

     fileInput("graph", label = h4("Pajek file")),

      downloadButton('downloadData', 'Download')

    ),
    mainPanel( tabsetPanel(type = "tabs", 
                           tabPanel("Table", tableOutput("view")) 

                           ) 

               )

  )
))

服务器

library(igraph)
options(shiny.maxRequestSize=100*1024^2) 

shinyServer(
  function(input, output) {

    filedata <- reactive({
      inFile = input$graph
      if (!is.null(inFile))
      data <<- read.graph(file=inFile$datapath, format="pajek")
    })


   output$view <- renderTable({
  if(is.null(filedata())) {
    return()
  }
  df <- filedata()
  vorder <-sort(degree(df), decreasing=TRUE)
  DF <- data.frame(ID=V(df)[vorder], degree=degree(df)[vorder])
})

    output$downloadData <- downloadHandler(
  filename = function() {
    paste(input$graph, '.csv', sep='')
  },

  # This function should write data to a file given to it by
  # the argument 'file'.
  content = function(file) {
  write.csv(DF, file)
      } 

    )
      }) 

我不确定如何从读取图的filedata（）方法中获取文件，然后获取pajek文件的度数，然后将其输出到CSV文件中，其中度数最高的是底部，最低的是。

并且所需的CSV文件列应具有：1.顶点ID 2.该顶点的度

Answer 1

我可能会误读您的脚本，但是我认为您需要将所有数据提取和操作都从“ server.R”文件的shinyServer()部分移到它之前的空间。 通常， shinyServer()插槽中唯一shinyServer()东西是在应用程序中呈现反应式元素的代码。 这些反应性元素的所有准备工作都应在调用shinyServer() 。 有关“ server.R”脚本的推荐结构的更多信息，请参见Shiny教程的这一部分 。