使用r markdown和knitr访问由R脚本生成的数据

Question

我是R markdown和knitr的新手，尚未找到此问题的答案：

我在R脚本中编写了函数，并已将数据分配到位置1（.GlobalEnv）。 如何在R markdown中访问数据并运行函数，并使用knitr生成.html文件？

这是一个简单的例子。 在脚本文件中，我生成：

some.x.data<-1:10
some.y.data<-1:10
toy.fn<-function(){
  tot<-some.x.data + some.y.data
  tot
}

toy.fn（）在脚本文件中工作。

我的R markdown文件包含：

---
title: "trivial test"
author: "me"
date: "July 9, 2015"
output: html_document
---


```{r}
plot(some.x.data, some.y.data)
toy.fn()
```

单击编织HTML时，出现以下错误：

绘图错误（some.x.data，some.y.data）：找不到对象'some.x.data'调用：... withCallingHandlers-> withVisible-> eval-> eval-> plot

谢谢

Answer 1

RStudio打开一个新的R会话knit()您的Rmd文件，所以在对象.GlobalEnv将无法使用该会话（它们是两个单独的会话），所以当你knitr荷兰国际集团HTML没有办法知道some.x.data ， some.y.data和toy.fn是。

要么你需要重新创建他们在您的Rmd文件。 如果您不希望任何输出，请执行以下操作：

```{r, echo = FALSE, message = FALSE}
some.x.data<-1:10
some.y.data<-1:10
toy.fn<-function(){
  tot<-some.x.data + some.y.data
  tot
}
```

完整Rmd ：

---
title: "trivial test"
author: "me"
date: "July 9, 2015"
output: html_document
---
```{r, echo = FALSE, message = FALSE}
some.x.data<-1:10
some.y.data<-1:10
toy.fn<-function(){
  tot<-some.x.data + some.y.data
  tot
}
```
```{r}
plot(some.x.data, some.y.data)
toy.fn()
```

要么

自己手工knit ： library(knitr); knit('your_file.Rmd') library(knitr); knit('your_file.Rmd')