将Excel文件读入Shiny

Question

我是Shiny的新手，正在尝试使用excel文件中的数据运行应用程序。 看起来应该很简单，但无法弄清楚。 那里有大量信息，可以执行更复杂的任务（以交互方式上传文件，在其中指定列，文件位置等）-但我想要的只是一个使用来自后台加载的单个excel文件中数据的应用程序。

之前曾问过类似的问题（ 将csv文件上传到ShinyApps.io和R Shiny读取csv文件 ），但我没有从他们那里得到令人满意的答案。

我的excel文件保存在与app.R文件相同的目录下的“数据”文件夹中。 我将其读入脚本的server部分，如下所示：

server <- function(input, output){
  # Read in data
  myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx')

当我运行app.R文件来测试应用程序时，它可以正常工作。 但是，当我使用shinyapps::deployApp('pathToWorkingDirectory')将其发布到Shiny网站时，我看到该应用程序的灰色版本没有交互性。 如果我模拟app.R文件中的数据（Excel文件就是该模拟数据，并使用write.xlsx写入excel），则该应用程序也可以很好地发布到网站上-仅当我取出用于模拟数据的代码时并将其替换为read_excel命令，它将停止工作。 我也尝试使用.csv文件而不是.xlsx，但是存在相同的问题。

我已经从下面的app.R文件复制了完整的代码。

我究竟做错了什么？ 谢谢你的帮助。

library('ggplot2')
library('shiny')
library('psych')
library('readxl')

#===============
#This code makes a histogram, a coplot, and a prediction for species richness ('SpNat') given Forest cover ('NBT').
#===============

m1 <- lm(SpNat ~ NBT, data=myDF) #For prediction. best to create all non-reactive [ie non-updating] code outside the app, so it doesn't have to run every time.

#==========
# ui section
#==========

ui <- fluidPage(

  ### MAKING A TITLE
  titlePanel("Dashboard based on excel data"),

  ### DIVIDING INPUTS TO SIDEBAR VS MAIN PANELS:
  sidebarLayout(

    sidebarPanel(                                                           #everything nested in here will go in sidebar
  #dropdown input for coplot:
  tags$h3('Select coplot variables'), #heading
  selectInput(inputId='choiceX', label='Choose X variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Choices are concatenated text strings. 
  selectInput(inputId='choiceY', label='Choose Y variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')),
  selectInput(inputId='choiceZ', label='Choose conditioning variable', 
              choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')),
#checkbox input for pairs plots:
  tags$h3('Select variables for pairs plots'), #heading
  checkboxGroupInput(inputId='vars', label='Choose at least two variables for pairs plot', 
                   selected=c('SpNat', 'NBT', 'PC'), #'determines which vars start off checked. Important for pairs, cos <2 and plot wont work.
                   choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Server receives input as a single concatenated text 

#slider input for prediction:  
  tags$h3('Predicting forest cover'), #heading
  sliderInput(inputId='num',label='Pick a forest cover level', value=10, min=1, max=100)),

  mainPanel(                                                               #everything nested in here will go in main panel
#specify output for app, including headings:
  tags$h3('Coplot:'),
  plotOutput(outputId='coplot'),
  tags$h3('Histogram:'),  
  plotOutput(outputId='pairs'),
  tags$h3('Predicted species richness:'),  
  verbatimTextOutput('prediction'))))

#==========
# server section
#==========

server <- function(input, output){
  # Read in data
  myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx') #don't need full path
  myDF$PC <-  as.factor(myDF$PC)
  myDF <- select(myDF, SpNat, NBT, PC)

  #create output object, and name it so it corresponds to the ui output function ID, plus use the ui input ID to create it: 
  output$coplot <- renderPlot(
    ggplot(myDF, aes_string(input$choiceX, input$choiceY, col=input$choiceZ)) + geom_point())    #note use of aes_string to allow inputID use direct.
  output$pairs <- renderPlot({
    pairs.panels(subset(myDF, select=input$vars))})
  output$prediction <- renderPrint({
    newData <- data.frame(NBT=input$num)
    cat(predict(m1, newdata = newData))
  })
}

#==========
# and stitch together
#==========

shinyApp(ui=ui, server=server)

Answer 1

弄清楚了。 我有两个问题：

（1）在发布之前，我已将应用复制到新文件夹中，因此工作目录已更改-需要在运行shinyapps::deployApp之前重置为包含我的app.R文件的文件夹。

（2）应用程序所需的几个软件包会自动加载到R控制台中（我已对.Rprofile文件进行了更改）。 因此，虽然我不需要加载这些就可以在本地运行该应用程序，但是我确实将其在线发布了。

两者都是很愚蠢的错误，但是您可以生活和学习。