用python替代bash（awk命令）

Question

上下文：我在提供结果文件的程序上运行计算。 在这些结果文件（扩展名为.h5）上，我可以应用一个python代码（我无法更改此python代码），以便它给我一个方矩阵：

oneptdm.py resultfile.h5

以我为例：

1   2  3  4
5   6  7  8
9  10 11 12
13 14 15 16
points groups
1
2
3
...

在名为oneptdm.dat的文件中

我想grep这个矩阵的对角线。 通常我只使用bash：

awk '{ for (i=0; i<=NF; i++) if (NR >= 1 && NR == i) print i,$(i) }' oneptdm.dat > diagonal.dat

但是由于x的原因，我现在必须使用python来做。 我怎样才能做到这一点 ？ 我当然可以再次使用“子进程”再次使用awk，但我想知道是否存在使用2.6版python脚本进行此操作的替代方法。 结果应为：

(line)  (diagonal element)
1       1
2       6
3       11
4       16

Answer 1

您可以尝试如下操作：

with open('oneptdm.dat') as f:
    for i, l in enumerate(f):
        print '%d\t%s' % (i + 1, l.split()[i])

Answer 2

这应该可以解决问题。 它确实假设文件以方阵开头，并且该假设用于限制从文件读取的行数。

with open('oneptdm.dat') as f:
    line = next(f).split()
    for i in range(len(line)):
        print('{0}\t{1}'.format(i+1, line[i]))
        try:
            line = next(f).split()
        except StopIteration:
            break

示例文件的输出：

1   1
2   6
3   11
4   16