从bash向Python脚本传递参数

Question

由于对Python非常陌生，我试图从bsPlugins运行以下Python脚本： https : //github.com/bbcf/bsPlugins/blob/master/bsPlugins/FileConvert.py
我下载了Python 2.7，这是必需的模块（biopython，bioscripts，bbcflib，bsPlugins），现在可以在bash中运行：

python FileConvert.py

没有任何错误信息。 我现在正在努力将参数传递给脚本。 我在源代码中看到了opt变量，但是对于如何使用它们，或者至少获得有关预期语法的信息一无所知。

Answer 1

接受python中命令行参数的一种简单方法是使用sys模块，如下所示：

import sys
print str(sys.argv)

因此，当您在终端中运行python FileConvert.py arg1 arg2 arg3时，您将获得以下输出：

['FileConvert.py', 'arg1', 'arg2', 'arg3']

始终记住， argv是字符串列表，而argv[0]保存的第一个参数是file name而不是arg1 。

希望这能回答您的问题:)

Answer 2

$ python FileConvert.py arg1 arg2 arg3

虽然，我也不认为该文件也接受命令行参数。 您可以使用sys.argv将其重写为接受参数

#!/usr/bin/python
import sys

print str(sys.argv)