导入 CSV 文件时出现语法错误 (Python)

Question

我对 Python 相当陌生，正在使用它来解析一些数据。 出于某种原因，当我运行时：

将 numpy 导入为 np

def main():

    try:
        sequencename, modelaccession, modelname, bitscore, e-value, -, hmmstart, hmmend, hmmlength, strandofhit, alignmentstart, alignmentend, envelopestart, envelopeend, sequencelength, descriptionoftargetsequence = np.loadtxt(('7202HEVRK3.csv')
                                                                                                                                                                                                                                    ,delimiter= ','
                                                                                                                                                                                                                                    ,unpack = True
                                                                                                                                                                                                                                    ,dtype='string')

        print sequencename

    except Exception, e:
        print str(e)

我收到语法错误。 如果有人能帮助我，我将永远感激不尽。 这是文件名：7202HEVRK3（它是一种 CSV 格式）。

编辑：语法错误是“无效语法”

Answer 1

发生语法错误是因为您试图为- （减号运算符）赋值。 通过将-更改为_语法错误将被删除，因为 python 将_作为占位符读取。 您很可能打算这样做，但忘记按下换档按钮。 还要从e-value删除-并将其替换为_ 。

请尝试以下操作：

try:
    sequencename, modelaccession, modelname, bitscore, e_value, _, hmmstart, hmmend, hmmlength, strandofhit, alignmentstart, alignmentend, envelopestart, envelopeend, sequencelength, descriptionoftargetsequence = np.loadtxt('7202HEVRK3.csv',
                                                                                                                                                                                                                                delimiter= ',',
                                                                                                                                                                                                                                unpack = True,
                                                                                                                                                                                                                                dtype='string')

    print sequencename

except Exception, e:
    print str(e)