我无法在Mac OS 10.11.5上运行R xlsx软件包 - El Capitan

Question

我正在尝试在R上运行xlsx包但返回此错误：

> library(xlsx)
JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead.
JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver.dylib
JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library.
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'xlsx', details:
 call: .jinit()
 error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1

Error: package or namespace load failed for ‘xlsx’

我在Stackoverflow上找到了这个链接无法在Mac OS 10.11上加载R xlsx包但它对我不起作用。

解决方案是在Mac终端上运行sudo R CMD javareconf ，然后在sudo R CMD javareconf上运行install.packages("rJava",type='source')但是当我运行sudo R CMD javareconf我的Mac给出了这个错误： sudo: R: command not found 。

有谁知道如何解决这个问题？

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OS版本：

$ sw_vers
ProductName:    Mac OS X
ProductVersion: 10.11.5
BuildVersion:   15F34

Java版本：

$ java -version
java version "1.8.0_60"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_60-b27)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.60-b23, mixed mode)

R版本：

> version
           _                           
platform       x86_64-apple-darwin13.4.0   
arch           x86_64                      
os             darwin13.4.0                
system         x86_64, darwin13.4.0        
status                                     
major          3                           
minor          2.3                         
year           2015                        
month          12                          
day            10                          
svn rev        69752                       
language       R                           
version.string R version 3.2.3 (2015-12-10)
nickname       Wooden Christmas-Tree

Answer 1

来自终端会话的错误消息实际上表明你的bash PATH没有R可执行文件的目录（或它的符号链接。）但我也想知道增加你的PATH值是否会成功。

El Capitan版本的OSX更改了安全策略并移动了用户安装软件的位置。 通过在终端提示符下发出此命令然后给出我的密码，我在使用javareconf失败后获得了成功：

sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib