从gml文件读取NetworkX中的Multigraph

Question

我正在尝试将gml文件读入多图对象； 但是，我收到以下错误：

NetworkXError: edge #1 (0--3) is duplicated

在gml文件中，边缘是重复的：

  edge [
    source 0
    target 3
    LinkLabel "Green"
  ]
  edge [
    source 0
    target 3
    LinkLabel "Brown"
  ]

据我了解，当输入为多图时，read_gml函数应返回多图。 我想念什么？

Answer 1

您的gml文件可能缺少graph [之下的multigraph 1 。 这是MWE。

import networkx as nx
G = nx.read_gml('test.gml')

print(type(G))              # <class 'networkx.classes.multigraph.MultiGraph'>
print(G.edges(data=True))   # [(0, 3, {u'LinkLabel': u'Green'}), (0, 3, {u'LinkLabel': u'Brown'})]

test.gml的内容，

graph [
  multigraph 1
  node [
    id 0
    label 0
  ]
  node [
    id 3
    label 3
  ]
  edge [
    source 0
    target 3
    LinkLabel "Green"
  ]
  edge [
    source 0
    target 3
    LinkLabel "Brown"
  ]
]