从 R 语言调用的 C 函数中的动态内存分配

Question

我正在编写一个调用 C 脚本的 R 包。 C 脚本使用动态确定长度的结构：数组forest->edges的长度取决于从 R 传递的数据。

typedef struct {
  unsigned int n_edge;
  ...
  unsigned int max_node;
  unsigned int edges[];
} forest;

forest * forest_new (unsigned int *n_edge) {
  forest *f = malloc(sizeof(forest) + (2 * *n_edge * sizeof(int)));
  f->n_edge     = *n_edge;
  ...
  f->max_node   = 0;
  return f;
}

代码在 C 中成功运行，但在 R 调用触发forest_new时崩溃。 我的直觉是从内存分配的碰撞结果，并且实际上ř手册提到分配存储器的替代手段（例如R_alloc ， Calloc ），该线程 别处似乎表明应该代替使用malloc / calloc 。

所以问题的第 1 部分是对malloc / calloc调用何时应该或必须被 R 安全等价物替换（也许它们与我的问题无关？）。 问题的第 2 部分是 R 安全函数如何处理长度是动态确定的结构。

Answer 1

您可以在包中使用malloc/calloc和free来分配和释放内存，但您必须像在任何 C 应用程序中一样处理内存不足错误。 您可以使用 R 提供的Calloc/Free/Realloc ，然后您将获得以“R 方式”处理的错误（内存不足时的 R 错误）。 R_alloc函数允许您分配在外部函数退出时自动释放的临时数据（当您返回 R 时，它是基于堆栈的分配）。

R 不关心您的 C 代码是否使用动态确定长度的结构（灵活数组），R 根本不访问您的结构。

如果您需要更多帮助，请发布一个独立的示例或提供有关错误的更多信息。 或许，这也是值得一试n_edge已经在正确的/理智值forest_new 。