使用hl7apy解析HL7时出错

Question

我正在使用hl7apy来解析python中的hl7文件，我正在关注此链接。 当我使用sample.hl7时，我得到了期望的结果，但是当我使用自己的hl7文件时，我得到了以下错误

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 2, in <module>
  File "hl7apy/parser.py", line 82, in parse_message
    m.structure_by_name)
  File "hl7apy/parser.py", line 144, in parse_segments
    reference))
  File "hl7apy/parser.py", line 189, in parse_segment
    reference=reference)
  File "hl7apy/core.py", line 1564, in __init__
    validation_level, traversal_parent)
  File "hl7apy/core.py", line 632, in __init__
    self._find_structure(reference)
  File "hl7apy/core.py", line 808, in _find_structure
    structure = ElementFinder.get_structure(self, reference)
  File "hl7apy/core.py", line 524, in get_structure
    raise InvalidName(element.classname, element.name)
  hl7apy.exceptions.InvalidName: Invalid name for Segment: 

我不明白我在做什么错。

编辑：这是我正在使用的示例。

MSH|^~\&|SQ|BIN|SMS|BIN|20121009151949||ORU^R01|120330003918|P|2.2
PID|1|K940462|T19022||TEIENT|JYSHEE|1957009|F|MR^^RM^MR^DR^MD^3216|7|0371 HOES LANE^0371 HOES LANE^NORTH CENTRE^FL^0854^INDIA^P^98|^UA^|(21)2-921|203960|ENG^ENGLISH^HL7096^ENG^ENGLISH^9CLAN|U|^HINU^|^^^T1M|05-1-900||||NW HAVEN||||PAS|NOTH CETRE|
PV1|1|I|BDE^BDE||||960^FALK,HENRY^^^MD|||MED|||||||960^FALK,HENRY^^^MD||22599|||||||||||||||||||||||||20160613102300||||
ORC|RE|10112|1705||D||^^^20103102300^216061102300||201208100924|PS||10084^BRUCE^PALTHROW|||201606310230|
OBR|1|10112|1705|1786-6^HEMOGOI A1C|||201606131300|201606131300||SGR||||201208056||1029^BONE,EAN|3-266-91|||||201280058||CH|F||R^^^2012070957|||||104^VRNEY,SCT|
OBX|1|NM|1856-6^LOINC^LN^HEMOGOI A1C^L||5.9|%|4.2-6.3||||F|||20160613|A^^L

代码：这是我用来解析我的hl7文件的代码，也是我解析上面链接中提到的示例hl7文件时使用的代码。

from hl7apy import parser
from hl7apy.exceptions import UnsupportedVersion

hl7 = open('ICD9.hl7', 'r').read()

try:
    m = parser.parse_message(hl7)
except UnsupportedVersion:
    m = parser.parse_message(hl7.replace("n", "r"))

Answer 1

您应该在此处显示文件中的消息以获取definitiv答案。

但是，最可能的原因是文件的内容不符合HL7规则。 您确定使用正确的段定界符（ASCII 13或HEX 0D）吗？ 您是否使用非标准细分受众群名称？

只需通过免费在线HL7消息验证进行检查即可获得这些信息

ID  ELEMENT_TYPE POSITION   LINE_NO VALIDATION ERROR
1   Field        MSH.9.3    1       Component required
2   Field        PID.7      2       Invalid date time format : '1957009'
3   Component    PID.9.7    2       Invalid table entry value : '3216' for table Name Type
4   Component    PID.9.7    2       Value '3216' length (4) exceed limit (1)
5   Component    PID.11.6   2       Invalid table entry value : 'INDIA' for table Country Code
6   Component    PID.11.6   2       Value 'INDIA' length (5) exceed limit (3)
7   Field        PID.12     2       Field should not contain component(s)
8   Component    PID.18.1   2       Field required but has no value.
9   Field        ORC.5      4       Invalid table entry value : 'D' for table Order status
10  Component    ORC.7.4    4       Invalid date time format : '20103102300'
11  Component    ORC.7.5    4       Invalid date time format : '216061102300'
12  Field        ORC.15     4       Invalid date time format : '201606310230'
13  Field        OBR.14     5       Invalid date time format : '201208056'
14  Field        OBR.22     5       Invalid date time format : '201280058'
15  SubComponent OBR.27.1.1 5       Invalid numeric format : 'R'
16  Component    OBR.27.4   5       Invalid date time format : '2012070957'
17  Component    OBR.32.2   5       Invalid date time format : 'VRNEY,SCT'

但这不能解释您的错误信息。 确定要阅读消息文件并解析内容吗？

您的代码中有错误。 它应该是

hl7.replace("\n", "\r")

如果要替换错误的段定界符。