[英]Reshaping a data frame based on column names
我有一个包含1个观察值和136个变量的数据框。 每个变量是不同集合的唯一组合,观察结果是两个集合之间的收敛分数。 原始df的简化版本如下所示:
#Original df
mydf <- data.frame(setA_setB = c(11), setA_setC = c(21), setB_setC = c(31))
mydf
我想要得到的是一个看起来像这样的数据框:
#Final df
final.mydf <- data.frame(set = c("setA", "setB", "setC"), setA = c(NA, 11, 21), setB = c(11, NA, 31), setC = c(21, 31, NA))
final.mydf
因此,有必要先创建将mydf的colname分隔为“ _”的列名和行名,而我一直使用以下代码进行此操作:
#List of set names:
setNames <- unique(unlist(strsplit(colnames(mydf), "_")))
然后,我不知道如何根据列名为矩阵的每个条目分配正确的值。
这是tidyverse
一种选择
library(tidyverse)
data_frame(key = c(names(mydf), sub("(\\w+)_(\\w+)", "\\2_\\1", names(mydf))),
val = rep(unlist(mydf), 2)) %>%
separate(key, into = c("set", "key2")) %>%
spread(key2, val)
# A tibble: 3 × 4
# set setA setB setC
#* <chr> <dbl> <dbl> <dbl>
#1 setA NA 11 21
#2 setB 11 NA 31
#3 setC 21 31 NA
我建议的cast
从功能reshape
包。 我们首先重新定义您的数据框
redf <- data.frame(cbind(do.call(rbind,(strsplit(names(mydf),"_"))),t(mydf)),stringsAsFactors = F)
names(redf) <- c("set1","set2","value")
redf
# set1 set2 value
# setA_setB setA setB 11
# setA_setC setA setC 21
# setB_setC setB setC 31
前两列是两组,第三列是相应的值。 由于您需要一个矩阵,因此表示“双向”。 我们切换set1和set2
invdf <- subset(redf,set1!=set2)
names(invdf) <- c("set2","set1","value")
invdf
# set2 set1 value
# setA_setB setA setB 11
# setA_setC setA setC 21
# setB_setC setB setC 31
最后结合两个数据框并使用cast
alldf <- rbind(redf,invdf)
alldf$value <- as.numeric(alldf$value)
alldf
library(reshape)
cast(alldf,set1~set2,sum)
# set1 setA setB setC
# 1 setA 0 11 21
# 2 setB 11 0 31
# 3 setC 21 31 0
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