根據列名重塑數據框

Question

我有一個包含1個觀察值和136個變量的數據框。 每個變量是不同集合的唯一組合，觀察結果是兩個集合之間的收斂分數。 原始df的簡化版本如下所示：

#Original df
mydf <- data.frame(setA_setB = c(11), setA_setC = c(21), setB_setC = c(31))
mydf

我想要得到的是一個看起來像這樣的數據框：

#Final df
final.mydf <- data.frame(set = c("setA", "setB", "setC"), setA = c(NA, 11, 21), setB = c(11, NA, 31), setC = c(21, 31, NA))
final.mydf

因此，有必要先創建將mydf的colname分隔為“ _”的列名和行名，而我一直使用以下代碼進行此操作：

#List of set names:
setNames <- unique(unlist(strsplit(colnames(mydf), "_")))

然后，我不知道如何根據列名為矩陣的每個條目分配正確的值。

Answer 1

這是tidyverse一種選擇

library(tidyverse)
data_frame(key = c(names(mydf), sub("(\\w+)_(\\w+)", "\\2_\\1", names(mydf))), 
        val = rep(unlist(mydf), 2)) %>%
   separate(key, into = c("set", "key2")) %>%
   spread(key2, val)
# A tibble: 3 × 4
#    set  setA  setB  setC
#* <chr> <dbl> <dbl> <dbl>
#1  setA    NA    11    21
#2  setB    11    NA    31
#3  setC    21    31    NA

Answer 2

我建議的cast從功能reshape包。 我們首先重新定義您的數據框

redf <- data.frame(cbind(do.call(rbind,(strsplit(names(mydf),"_"))),t(mydf)),stringsAsFactors = F)
names(redf) <- c("set1","set2","value")
redf
#           set1 set2 value
# setA_setB setA setB    11
# setA_setC setA setC    21
# setB_setC setB setC    31

前兩列是兩組，第三列是相應的值。 由於您需要一個矩陣，因此表示“雙向”。 我們切換set1和set2

invdf <- subset(redf,set1!=set2)
names(invdf) <- c("set2","set1","value")
invdf
#           set2 set1 value
# setA_setB setA setB    11
# setA_setC setA setC    21
# setB_setC setB setC    31

最后結合兩個數據框並使用cast

alldf <- rbind(redf,invdf)
alldf$value <- as.numeric(alldf$value)
alldf
library(reshape)
cast(alldf,set1~set2,sum)
#   set1 setA setB setC
# 1 setA    0   11   21
# 2 setB   11    0   31
# 3 setC   21   31    0