子集 igraph plot 在使用中激活 function 在 R

[英]Subset igraph plot in using activate function in R

我正在嘗試對 igraph plot 進行子集化，以根據給定的頂點屬性顯示某些節點。 我必須在 plot output 中對它們進行子集化，以保留頂點的布局。 我的代碼如下： 但我收到以下錯誤： 如何根據頂點屬性“V(graph)$period”對圖形進行子集化，同時保持頂點的布局？ ...

使用 ggraph 將 pi 數字繪制為連接束

[英]Plotting pi digits as connection bundles with ggraph

我希望將 Pi 的數字繪制為分層邊束，如圖所示 在這里，Pi 的數字按其顏色分組，然后每個數字都有一條邊連接到它后面的數字（即，如果 Pi 為 3.141，則 3 將有一條邊繪制到 1，1 將有一條邊連接到它后面的數字） 4，以此類推）。 這是我到目前為止的代碼 然而，這是拋出錯誤 ...

在沒有 map 的 Tidygraph 中節點附近的變異函數

[英]Mutate functions on the neighborhood of a node in Tidygraph without a map

我有一個帶有屬性W的圖表。 我想mutate鄰居的平均W 我想讓代碼盡可能簡單，盡量避免使用maps和其他顯式函數進行矢量化，因為這是出於教學目的。 我的代碼試圖很好地展示每個段落，如下所示： 有沒有辦法執行這些操作而不會重復到map ？ Tidygraph 有一個類似的包裝器，它是local_a ...

帶日期軸的網絡圖

[英]Network Diagram with Date Axis

我想創建一個 X 軸及時固定的定向網絡可視化。 假設我有以下數據： 節點 ID Label 日期 1 一個 2022-02-01 2 b 2022-03-13 3 c 2022-03-22 4 d 2022-04-20 邊緣從至 1 2 3 1 3 4 我想創建一個如下 ...

R 中的網絡圖

[英]Network Graph in R

我想從我擁有的 dataframe 構建網絡圖，但我遇到了麻煩。 這就是 dataframe 的樣子。 店鋪經理 S1 34 S1 12 S2 11 S2 34 S3 34 S4 50 例如，S1 應該連接到 S2 和 S3，因為它們具有相同的管理器，依此類推。 另外，是否可以 ...

tidygraph 中的 Label 個樹枝

[英]Label tree branches in tidygraph

我有一個有 116 棵樹的有根森林作為tidygraph object。我現在想向節點添加一個新屬性，即 label 分支內的節點。 例如，對於一個圖 我想在節點數據中有一列c("A", "A", "A", "B", "C", "B", "C", "C", "D", "E", "D", "E") ， ...

使用 ggraph 和 R 中的 tidygraph 生成具有 csv 屬性的多網絡圖

[英]Generating multiple network graphs with attributes from csv with ggraph, tidygraph in R

我有三個 csv 文件，如下所示： 實際上這個數據集包含兩個不同的圖，按object分組。 有人可以建議如何使用tbl_graph ggraph/tidygraph中的 tbl_graph 生成按object （“2-1887”和“4-1889”）分組的兩個圖嗎？ 如果我可以將這些 object 名 ...

R、igraph、tidygraph 中的圖學習

[英]Graph learning in R, igraph, tidygraph

我有一個圖表，每個節點都有一個值（紅色值）。 我想做以下兩件事（我猜1是2的特例）： 應該為每個節點分配指向它的直接對等點的值的平均值。 例如節點 #5 (1+2)/2=1.5或節點 #3 (0+2+0)/3=2/3 。 代替直接鄰居，包括所有連接的節點，但擴散時間為 1/n，其中 ...

如何在 R 中使用 tidygraph 對象 plot 單個節點？

[英]How to plot a single node using tidygraph objects in R?

我想知道是否有可能 plot 一個單一節點的 tidygraph object？ 例如，如果我創建一些數據和一個帶有 2 個節點的 tidygraph object，它看起來像這樣： 但是，我想知道我是否可以 plot 一個僅包含 1 個節點的 tidygraph object。 例如，如果我的 ...

如何加速 case_when/條件變異？

[英]How to speed up case_when/conditional mutate?

可以注意到case_when在滿足條件時不在公式中評估 tibble 的子集，而是整個 tibble，例如： 這在錯誤中很清楚： 另一種方法是rowwise()或group_by(id)但這仍然是非常低效的。 我可能仍會為rowwise()路由，但由於我只需要對 1% 的 tibble 執行操作， ...

在 R 中使用圖形和 tidygraph 為節點着色？

[英]Colouring nodes using graph and tidygraph in R?

我最近問了這個關於如何通過變量給節點着色的問題。 而且代碼效果很好。 但是，我回來嘗試分別為終端節點着色。 例如，如果我創建一些數據，然后將它們變成 tidygraph 對象並使用 ggraph 將它們變成 plot，那么我會得到這樣的結果： 如您所見，命名節點的顏色都正確，但終端節點的顏色為灰 ...

創建一個由未連接的、非常小的、完全連接的組件組成的網絡

[英]Create a network of unconnected, very small, full connected components

我的最終目標是這種無向邊緣列表： 每個 3 個組件的網絡，完全連接，一個有 1 個節點，一個有 2 個節點，一個有 3 個節點： 將有 6 個節點，但由於第一個組件僅由一個節點組成，因此節點 1 沒有邊。 但是組件的數量可能高於 3，比方說 30。組件內的平均邊數將在rpois(30,1)+1之后確 ...

用tidygraph和ggraph將列定義為y軸？ 食物網和網絡圖

[英]Defining a column as y-axis with tidygraph and ggraph? foodweb and network plots

社區！ 我有一個關於tidygraph::和ggraph::包的問題。 我正在嘗試創建一個食物 web 網絡 plot （下面的代碼和圖表），但是，我想使用定義 y 軸的 kk 布局，在我的例子中是來自 nodes_df 的 TL 列。 我創建了模擬數據以作為示例顯示。 如果有人對如何改進此 plo ...

如何根據 R 列表中的列重新排序 tidygraph 對象列表？

[英]How to reorder a list of tidygraph objects based on a column in the list in R?

我有一個tidygraph對象的列表。 我正在嘗試根據特定標准重新排序列表元素。 也就是說，我列表中的每個元素都有一個名為name的列。 我正在嘗試將具有相同name列的列表元素組合在一起......但我也想按其計數的降序對它們進行分組（即，每個列表元素中同name的計數）。 希望我的例子能解釋得 ...

從 R 中的 tidygraph 對象列表中刪除重復的元素？

[英]Remove duplicated elements from a list of tidygraph objects in R?

我有一個 tidygraph 對象的列表。 在節點數據中，我有兩列，即name和frequency 。 我想要做的是刪除任何重復多次的列表元素（即tidygraph 對象）。 希望我的例子可以解釋更多： 首先，我創建了一些節點/邊緣數據，將它們轉換為 tidygraph 對象並將它們放在一個列表中 ...

計算R中tidygraph對象列表中相同列的頻率？

[英]Count the frequency of identical columns in a list of tidygraph objects in R?

我有一些包含在列表中的 tidygraph 對象。 我正在嘗試計算相同的列（在 tidygraph 節點數據內）的頻率。 例如， 如果我創建一些節點和邊緣數據，將它們轉換為 tidygraph 對象，並將它們放在一個列表中，如下所示： 我們可以看到tg 、 tg_1和tg_2都有相同的nam ...

R：返回所有簡單路徑的邊列表

[英]R: Return list of edges of all simple paths

我正在嘗試使用 tidygraph 獲取兩個節點之間路徑的邊緣列表。 這是一個例子 我使用 igraph 包中的 all_simple_paths 來獲取節點 B 和節點 C 之間的所有可能路徑。 我想知道如何為所有簡單路徑生成邊列表。 謝謝你。 ...

R中同一窗口中的多個不同大小的圖？

[英]multiple different sized plots in same window in R?

類似的問題已經被問過很多次了，例如這里和這里。 但是，到目前為止我看到的所有其他答案都沒有真正解決我的問題。 我試圖在同一個窗口中繪制多個不同大小的圖。 我正在使用tidygraph對象並使用ggraph創建繪圖。 我嘗試使用gridExtra和cowplots ，但是，我似乎無法讓它們按我想要的 ...

計算包含 R 中列表的矩陣的相同列？

[英]Count identical columns of a matrix containing lists in R?

我正在處理的數據是一個矩陣，其中矩陣中的每一列都是一個包含 2 個元素的列表。 我想要做的是計算有多少列是相同的。 我正在從tidygraph對象中提取列表矩陣。 我下面的例子應該能更好地解釋我的問題。 首先，我創建了一些數據，將它們轉換為tidygraph對象並將它們全部放入一個列表中，如下所示 ...

在R中使用整潔圖時按變量着色？

[英]Colouring by variable when using tidy graph in R?

我試圖想出一種方法來一致地為多個tidygraph圖着色。 現在，問題是，當我一次在屏幕上繪制多個圖時， tidygraph為每個變量選擇不同的顏色。 希望我下面的例子能解釋這個問題。 首先，我創建了一些數據，將它們轉換為tidygraph對象，然后將它們放在一個列表中： 然后我有一個繪圖功能 ...