igraph 節點注釋帶有外部注釋信息

[英]igraph node annotation with external annotation information

這是在我有 colors 來自我想要的模塊 label 的地方解決的問題。現在我想知道如果我有另一個節點文件我該如何放置注釋我想要我的圖表像這樣或類似的東西 他們根據基因的功能富集對網絡進行了注釋這是我生成基本圖我的文件的基本代碼 Plot 數據 V(g) # 節點 V(g)$name # 每個節 ...

無法使用 R/ggraph 在圓形樹狀圖上按組對線條進行着色

[英]Unable to color lines by group on a circular dendogram using R/ggraph

我使用 R 和ggraph package 創建了一個圓形樹狀圖。我的標簽和節點已按“組”正確着色。 但是，我不確定如何通過“顏色”（我的顏色列）為線條着色。 目前我可以將線條顏色更改為單一顏色（例如“紅色”），但我不能按“顏色”列動態地為它們着色。 我的代碼基於r-graph gallery 網站 ...

我如何在 r 圓形圖中標記僅連接的節點

[英]how can i label only connected node in r circular plot

只有當他們有聯系時，我才想給情節貼上標簽。 我的數據是 代碼是 ...

是否可以用超過 100 的大型數據集制作層次圖？

[英]Is it possible to do a hierarchical diagram with a large dataset over 100?

我正在嘗試創建一個層次圖（像樹結構，但最好是在一個圓圈中），它反映了從單個樣本到物種再到它所屬的標簽的三向連接。 本質上強調所有這些都是不同的物種，但它們屬於同一標簽。 然而，當我嘗試創建我的圖表時，我的標簽是重疊的，你看不到每個部分是什么，一切都變得超級濃縮。 當我使用較小的樣本量（如 20 種 ...

R ggraph 方面

[英]R ggraph facets

我很難弄清楚如何正確地刻面圖。 請參見以下示例。 該圖幾乎沒問題，除了我希望每個面板只有通過邊有效連接的節點：即沒有“孤兒”節點，如面板“face_A”中的節點“O”或節點“P”在面板“face_B”中。 鑒於此，我希望facet_nodes將成為我的潛在解決方案，方法是僅繪制由變量映射的節點以及該 ...

找不到 function“try_fetch”

[英]could not find function "try_fetch"

我正在嘗試創建網絡 plot，但它似乎不起作用。 這是我的代碼 R 顯示此錯誤消息 ...

如何在邊緣的特定位置繪制箭頭？

[英]How to draw an arrowhead on a specific position on an edge?

我有一個圖表，其中每條邊都是其節點之間的所有權分布。 例如，在“A”和“B”之間的邊中，“A”擁有 90%，而“B”僅擁有 10%。 我想通過在該所有權的相對位置的邊緣放置一個圓弧來形象化這一點。 我怎樣才能做到這一點？ 我更喜歡使用ggraph並使用箭頭來可視化相對所有權，但我願意接受其他建議。 ...

使用 ggraph 將 pi 數字繪制為連接束

[英]Plotting pi digits as connection bundles with ggraph

我希望將 Pi 的數字繪制為分層邊束，如圖所示 在這里，Pi 的數字按其顏色分組，然后每個數字都有一條邊連接到它后面的數字（即，如果 Pi 為 3.141，則 3 將有一條邊繪制到 1，1 將有一條邊連接到它后面的數字） 4，以此類推）。 這是我到目前為止的代碼 然而，這是拋出錯誤 ...

如何使用 geom_node_circle 動態分配邊框顏色？

[英]How to dynamically assign border color using geom_node_circle?

我正在嘗試使用geom_node_circle更改ggraph中節點的邊界。 我想根據節點名稱與我為名稱提供的 colors 之間的映射來設置邊界 colors。 我知道改變邊框的參數是colour 。 制作圖表例如： 我知道如何將所有邊框更改為一種新顏色（紅色）： 但是，我不知道如何根據grap ...

分層 plot 與 r 中的氣泡

[英]Hierarchical plot with bubbles in r

在這個頁面上，我發現了一個有趣的 plot： 是否有可能做類似或完全一樣的事情？ （ treemap和ggraph庫的結合）。 ...

帶日期軸的網絡圖

[英]Network Diagram with Date Axis

我想創建一個 X 軸及時固定的定向網絡可視化。 假設我有以下數據： 節點 ID Label 日期 1 一個 2022-02-01 2 b 2022-03-13 3 c 2022-03-22 4 d 2022-04-20 邊緣從至 1 2 3 1 3 4 我想創建一個如下 ...

查找 R 中一列的值之間的連接並構建網絡圖

[英]Find connections between values of one column in R and build network grapgh

我想計算一列的行之間有多少共同值。 這是我的 dataframe 的樣子： 地點經理 L1 M45 L2 M45 L34 M12 L5 M45 L23 M12 L4 M3 L11 M45 我想創建一個包含兩列的新 dataframe：位置和鏈接。 新的鏈接列應包含通用管理器 ...

R ggraph / igraph geom_edge_link2 為因子變量定義自定義顏色

[英]R ggraph / igraph geom_edge_link2 define custom color for factor variable

我正在嘗試更改邊緣的顏色。 目前圖表顯示如下 雖然根據圖形屬性“Polarität”（極性）對邊緣進行着色，但我想將其從默認的 ggplot 紅色和藍色配色方案中切換。 我對如何做到這一點感到困惑。 提前致謝 ...

同一圖上不同類型邊的不同美學尺度

[英]Different aesthetic scales for different types of edges on same graph

我正在嘗試使用 ggraph 包可視化一些網絡。 我的網絡有兩種不同類型的邊 A 和 B，它們具有不同的尺度。 我想按類型（我已經完成）為邊緣着色，並通過值調節它們的不透明度。 但是，由於所有邊緣都顯示在一起並且由於 A 和 B 具有不同的比例，因此使用aes(alpha=value)會在 A 和 ...

使用ggraph時，如果標簽文本在圖中重疊，如何審查數據點標簽（注釋）

[英]how to censor data point labels (annotations) if label text overlaps in the plot when using ggraph

我正在嘗試使用ggraph繪制一些數據。 樣式為circular partition圖。 我有很多圖/圖表。 每個都具有不同密度的樹枝狀分支。 圖上的節點用geom_node_text(aes(label = labelText)) 。 我知道我可以使用縮放或文本大小來調整有效字體點。 但是，在給定 ...

如何更改 ggraph 中標簽的顏色或形狀？

[英]How do I change the color or shape of the labels in ggraph?

我在編碼方面還是新手，在更改 ggraph 中標簽的顏色或形狀時遇到了麻煩。 這些節點屬於兩個不同的組，我希望能夠看到兩者之間的區別。 意思是“標准”是一種顏色，“扇區”是另一種顏色。 我該怎么做呢？ 下面我附上了我的數據、代碼和繪圖。 數據1 代碼 陰謀 ...

ggraph 使填充箭頭邊緣出現在圖例中

[英]ggraph make filled arrow edges appear in legend

我正在嘗試制作 EDA 歷史的系譜圖，為博士學位Institution的邊緣和箭頭着色。 這類作品，但圖中的實心箭頭在圖例中顯示為空心。 有什么方法可以得到我想要的嗎？ 這是我的 MWE： 這是我的圖表： 編輯 這是數據：作為鏈接： https ://www.dropbox.com/s/ ...

ggraph 指定節點的填充和顏色

[英]ggraph specify both fill and colour of nodes

我已經看到了如何從美學中獲取節點填充並將顏色設置為在節點周圍有黑色邊距的示例。 但是，如果我嘗試指定固定顏色並填充，我只會得到黑色節點。 在這種情況下如何指定顏色？ ...

使用 R 在網絡圖中根據連接的節點大小縮放邊的起點和終點

[英]Scale the start- and end-point of the edge against the connected node size in the network plot using R

提前感謝您的幫助！ 我的問題是，給定一個集合列表，我如何使用網絡圖可視化兩個集合中任何一個的重疊，如下所示？ 請隨時生成任何集以供演示。 或者您可以使用以下簡單集。 ...

使用 ggraph 和 R 中的 tidygraph 生成具有 csv 屬性的多網絡圖

[英]Generating multiple network graphs with attributes from csv with ggraph, tidygraph in R

我有三個 csv 文件，如下所示： 實際上這個數據集包含兩個不同的圖，按object分組。 有人可以建議如何使用tbl_graph ggraph/tidygraph中的 tbl_graph 生成按object （“2-1887”和“4-1889”）分組的兩個圖嗎？ 如果我可以將這些 object 名 ...