[英]Display this decision tree with Graphviz
我正在关注关于使用 python v3.6 使用 scikit-learn 进行机器学习的决策树的教程。
这是代码;
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import mglearn
import graphviz
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
cancer = load_breast_cancer()
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(cancer.data, cancer.target, stratify=cancer.target, random_state=42)
tree = DecisionTreeClassifier(random_state=0)
tree.fit(X_train, y_train)
tree = DecisionTreeClassifier(max_depth=4, random_state=0)
tree.fit(X_train, y_train)
from sklearn.tree import export_graphviz
export_graphviz(tree, out_file="tree.dot", class_names=["malignant", "benign"],feature_names=cancer.feature_names, impurity=False, filled=True)
import graphviz
with open("tree.dot") as f:
dot_graph = f.read()
graphviz.Source(dot_graph)
如何使用 Graphviz 查看 dot_graph 内部的内容? 据推测,它应该看起来像这样;
在 jupyter notebook 中,以下绘制了决策树:
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn import tree
model = DecisionTreeClassifier()
model.fit(X, y)
dot_data = tree.export_graphviz(model,
feature_names=feature_names,
class_names=class_names,
filled=True, rounded=True,
special_characters=True,
out_file=None,
)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph
如果要将其保存为 png:
graph.format = "png"
graph.render("file_name")
graphviz.Source(dot_graph)
返回一个graphviz.files.Source
对象。
g = graphviz.Source(dot_graph)
使用g.render()
创建图像文件。 当我在没有参数的情况下在您的代码上运行它时,我得到了Source.gv.pdf
但您可以指定不同的文件名。 还有一个快捷方式g.view()
,它保存文件并在适当的查看器应用程序中打开它。
如果您将代码原样粘贴在丰富的终端中(例如带有内联图形的 Spyder/IPython 或 Jupyter 笔记本),它将自动显示图像而不是对象的 Python 表示。
您可以使用来自 IPython.display 的显示。 这是一个例子:
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn import tree
model = DecisionTreeClassifier()
model.fit(X, y)
from IPython.display import display
display(graphviz.Source(tree.export_graphviz(model)))
我在 Windows 10 中工作。我通过添加到“路径”环境变量来解决这个问题。 我添加了错误的路径,我添加了 Drive:\Users\User.Name\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\MyVirtualEnv\lib\site-packages\graphviz 应该使用 Drive:\Users\User.Name\AppData\最后我使用了 Local\Continuum\anaconda3\envs\MyVirtualEnv\Library\bin\graphviz,然后重新启动了 python/anaconda。 还添加了 pydotplus 路径,位于 ....MyVirtualEnv\lib\site-packages\pydotplus。
Jupyter 将按原样显示图表,但如果您想放大更多,可以尝试保存文件并进一步检查:
# Draw graph
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data)
# Show graph
Image(graph.create_png())
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