使用R中的survminer软件包（ggsurvplot）更改审查事件的形状

Question

我正在使用survminer软件包在R中创建Kaplan-Meier-Curve，效果很好：

plotUICC=survfit(Surv(as.numeric(myData$eventtime),event=myData$eventtype)~myData$UICC, data = myData)

ggsurvplot(plotUICC,data=myData, risk.table = FALSE,pval = TRUE,conf.int = FALSE,legend.labs = c("UICC I", "UICC II"),legend = c(0.25, 0.26),legend.title = "",xlab = "Time in Months"))

用上面的鳕鱼创建的Kaplan Meier曲线

我想将“ +”更改为受检查事件，并使用简单的“ |” 代替。 不幸的是，help（ggsurvplot）和Google都无法帮助我。

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这些是已加载的软件包：

    other attached packages:
[1] ggthemes_3.4.0  survminer_0.3.1 ggpubr_0.1.2    ggplot2_2.2.1   survival_2.40-1
[6] readxl_0.1.1    gridExtra_2.2.1

Answer 1

下面是一个最小的工作示例：

library(survminer)
library(survival)
fit <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
p1 <- ggsurvplot(fit, data = lung)

理想情况下，您希望更改检查器的形状，例如：

p2 <- ggsurvplot(fit, data = lung, censor.shape=124)

我没有办法用原始的survminer软件包来做到这一点。 在survminer的分支中，我实现了此行为，因此产生了以下图：

可以在此处找到censor.shape的可接受值： http ://sape.inf.usi.ch/quick-reference/ggplot2/shape

我尚未对此进行全面测试，但是此扩展名对我已经非常有用。 “ +”审查员困扰了我一段时间。

编辑：此建议现已合并，ggsurvplot的开发版本现在接受censor.shape和censor.size参数：

ggsurvplot(fit, data = lung, censor.shape="|", censor.size = 4)