使用 survminer::ggsurvplot 在 r 中以编程方式绘制许多生存曲线的问题

Question

我可以使用 ggsurvplot 绘制如下所示的单个 Kaplan-Meier 图：

library(survminer)
library(survival)
fit1 = survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
ggsurvplot(fit1, data = lung)

但是，我需要以编程方式绘制许多 KM 图。 我需要将不同的变量作为字符串传递。 我在下面试过。

fml = as.formula(paste('Surv(time, status)~', 'sex'))
fit2 = survfit(fml, data = lung)
ggsurvplot(fit2, data = lung)

令人惊讶的是，这不起作用。 我收到以下错误消息：

Error: object of type 'symbol' is not subsettable

我不知道为什么会发生这种情况。 有谁知道如何解决这一问题？ 非常感谢。

Answer 1

由于在链接建议艾丹的评论，你需要使用的功能survminer::surv_fit()这大约是一个包装survival::survfit() 。 所以，在你的例子中，

library(survminer)
library(survival)
 # lung is distributed as an object, survival::lung
fit1 = surv_fit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)
ggsurvplot(fit1, data = lung)

然后可以绘制来自surv_fit(object.formula)的输出

fml = as.formula(paste('Surv(time, status)~', 'sex'))
fit2 = surv_fit(fml, data = lung)
ggsurvplot(fit2, data = lung)

在surv_fit帮助页面中，它还显示了如何拟合公式列表。