在Rcpp中编译多个源文件

Question

我有以下目录结构

my_func
    - my_func_r.cpp
    - my_func.c
    - my_func.h
    - my_func_test.c
    - matrix/
      - matrix.h
      - matrix.c

该matrix目录包含一些矩阵结构matrix.h和一些初始化，免费，打印等功能中matrix.c 。 my_func.h文件类似于

#include <math.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include "matrix/matrix.h"

... some structures and templates ...

然后是my_func.c文件

#include "my_func.h"

... helper functions ...

int my_func(...) {
    ... my_func stuff ...     
    return 0;
}

my_func_test.c类似于

#include "my_func.h"

int main() {
    ... some test ...
    return 0;
}

使用gcc/g++我可以用

gcc my_func_test.c my_func.c matrix/matrix.c -o test -lm

最终文件my_func_r.cpp是之间的界面Rcpp结构和使用的结构my_func.c 。 目前是这样的

#include "my_func.h"
#include <Rcpp.h>

// [[Rcpp::export]]
int my_func_r(Rcpp::List x, ...) {
    ... convert inputs to structure recognised by my_func.h ...       
    ... run my_func.c ...
    ... put returned objects back into one of the R structure ...

    return 0;
}

我的问题是如果我现在跑步

sourceCpp('my_func_r.cpp', verbose=TRUE, rebuild=TRUE)

它抱怨位于matrix/matrix.c函数缺少符号。 一种解决方法是简单地从两个粘贴我所有的头文件和源代码my_func和matrix在顶部文件my_func_r.cpp 。

但是，这对于解决代码维护尤其令人感到不满意。 完成我想做的最简单的方法是什么？

Answer 1

快速的：

1. 这是不是真的特别RCPP 本身
2. 您只是在R构建中挣扎着使用更高级/更复杂的src/目录。
3. 在编写R扩展中有关于此的官方文档，以前在SO上已经提过这些问题。
4. 您可以先在子目录中编译libmatrix.a并链接到该目录。 这可以通过一个简单的src/Makevars但仍然不建议这样做 。 继续阅读。
5. 但这是一个自我伤害的伤口。 只需将matrix.h和matrix.c复制到src/ ，调整包含路径，即可完成。
6. 与往常一样： 创建一个包 。 不要在较大的设置上使用sourceCpp() 。 不是为了这个