如何为R中的绘图热图生成自定义色标

Question

我想获得一个自定义的色阶，看起来像是可绘制的热图（ plot_ly(z = data, colors = customcolors, type = "heatmap") ）

palette <- colorRampPalette(c("darkblue", "blue", "lightblue1",
                          "green","yellow", "red", "darkred"))
plot(rep(1,50),col=palette(50), pch=19, cex=3, xlab = "", ylab ="", axes = F)

而蓝色端代表1，红色端代表10 ^ 6，并且绘制的数据在此间隔上具有变化的值。

Answer 1

您用于生成调色板的代码可以正常工作。 您只需要提供与heatmap匹配的数据即可。 以下代码提供了这一点：

library(RColorBrewer)
library(plotly)

# your palette definition
palette <- colorRampPalette(c("darkblue", "blue", "lightblue1",
                              "green","yellow", "red", "darkred"))

set.seed(9876)    # for reproducibility

## a complete random set
hmdata <- matrix(data = sample(x = 1:10^6, size = 100*100), nrow = 100, ncol = 100)
plot_ly(z = hmdata, colors = palette(50), type = "heatmap")

这给出了以下热图：

## a random set that has been sorted
hmdata_s <- matrix(data = sort(sample(x = 1:10^6, size = 100*100)), nrow = 100, ncol = 100)
plot_ly(z = hmdata_s, colors = palette(50), type = "heatmap")

产生此图：

请让我知道这是否是您想要的。

UPDATE

您可以设置自定义规模plot_ly与zauto ， zmax和zmin 。 以下2段代码和图表将说明这一点：

比例尺设置为1到100，数据的变化类似：

hmdata_s3 <- matrix(data = sort(sample(x = 1:100, size = 100*100, replace = TRUE)), nrow = 100, ncol = 100)
plot_ly(z = hmdata_s3, colors = palette(50), type = "heatmap", zauto = FALSE, zmin = 1, zmax = 100)

小数位设置为1到100，数据仅在50到100之间变化

hmdata_s4 <- matrix(data = sort(sample(x = 50:100, size = 100*100, replace = TRUE)), nrow = 100, ncol = 100)
plot_ly(z = hmdata_s4, colors = palette(50), type = "heatmap", zauto = FALSE, zmin = 1, zmax = 100)