库 (dylib) 未加载 - 找不到图像 - Python IDE

Question

基本上，我试图从 savReaderWriter 模块运行一些 Python 代码，以便创建一个可以在 IBM SPSS 中打开的 .sav 文件。 作为 macOS 用户，我需要先在终端中运行这两行，模块才能工作：

echo 'export DYLD_LIBRARY_PATH=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos'  >> ~/.bash_profile
echo 'export LC_ALL=en_US.UTF-8'  >> ~/.bash_profile

下面你可以看到我试图在 Python 中运行的一段代码：

import savReaderWriter

savFileName = "someFile.sav"
records = [['Test1', 1, 1], ['Test2', 2, 1]]
varNames = ['var1', 'v2', 'v3']
varTypes = {'var1': 5, 'v2': 0, 'v3': 0}
with savReaderWriter.SavWriter(savFileName, varNames, varTypes, ioUtf8=True) as writer:
    for record in records:
        writer.writerow(record)

我的问题是，当通过 terminal.app 在 Python 中运行代码时，就像一个 charm 一样工作并且出现了一个 new.sav 文件，试图在 IDE 中执行完全相同的代码（尝试过 PyCharm 和 Spyder）给我一个错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/IPython/core/interactiveshell.py", line 2847, in run_code
    exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)
  File "<ipython-input-2-94007b092d47>", line 7, in <module>
    with savReaderWriter.SavWriter(savFileName, varNames, varTypes, ioUtf8=True) as writer:
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/savWriter.py", line 198, in __init__
    super(Header, self).__init__(savFileName, ioUtf8, ioLocale)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/generic.py", line 29, in __init__
    self.spssio = self.loadLibrary()
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/generic.py", line 117, in loadLibrary
    spssio = self._loadLibs("macos")
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/generic.py", line 89, in _loadLibs
    return [load(os.path.join(path, lib)) for lib in libs][-1]
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/generic.py", line 89, in <listcomp>
    return [load(os.path.join(path, lib)) for lib in libs][-1]
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/ctypes/__init__.py", line 348, in __init__
    self._handle = _dlopen(self._name, mode)
OSError: dlopen(/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libicuuc48.1.dylib, 6): Library not loaded: @executable_path/../lib/libicudata48.1.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libicuuc48.1.dylib
  Reason: image not found

模块作者无法在这件事上帮助我，因此我很高兴收到这个社区的任何建议。

编辑（添加 sys.path）：

从终端：

 ['',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python36.zip',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/lib-dynload',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages',
 '/Users/mg/mne-python']

从集成开发环境：

['/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev',
 '/Users/mg/Documents/Python/Projects/MD',
 '/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python36.zip',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/lib-dynload',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages',
 '/Users/mg/mne-python',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/IPython/extensions',
 '/Users/mg/Documents/Python/Projects/MD']

问候，

名爵

Answer 1

找到解决方案！

基本上我需要为错误中出现的每个 dylib 创建符号链接，示例如下：

sudo ln -s /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libicudata48.1.dylib /usr/local/lib/libicudata48.1.dylib
sudo ln -s /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libicui18n48.1.dylib /usr/local/lib/libicui18n48.1.dylib
sudo ln -s /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libspssdio.dylib /usr/local/lib/libspssdio.dylib
sudo ln -s /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/libzlib123spss.dylib /usr/local/lib/libzlib123spss.dylib

所以从理论上讲：

sudo ln -s /path/to/original /path/to/symbolic/link

问候，

名爵

Answer 2

我将添加这个问题的答案只是为了让它更普遍。 本来希望发表评论但没有代表，虽然 Maciej 是完全正确的，但他的回答帮助我找到了我的问题。 savReaderWriter 已更新。 从版本 3.4.2 开始，现在有 6.dlyb 文件要复制。

获得文件夹路径后（路径是错误消息的位置），请确保在创建符号链接之前列出（终端窗口中的ls ）该文件夹中的所有文件。 然后为每个.dylib创建符号链接

再次感谢 Maciej 的出色回答！

Answer 3

对于其他懒惰的人：

ls /Users/your_user/anaconda/envs/quattro8/lib/python2.7/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/ | xargs -I {} sudo ln -s /Users/your_user/anaconda/envs/quattro8/lib/python2.7/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos/{} /usr/local/lib/{}

这链接了该仓库中的所有包

Answer 4

您还可以在 PyCharm 中指定库的路径，这样就无需创建符号链接：

从菜单栏中单击“运行”->“编辑配置”。 在左窗格中选择 python 脚本的配置（通常 PyCharm 会为每个 .py 文件创建一个配置）。 将库的路径（显示在错误消息中）插入“环境变量”。

示例： DYLD_LIBRARY_PATH=/Users/username/miniconda3/envs/savreader/lib/python3.6/site-packages/savReaderWriter/spssio/macos;

PyCharm 运行配置截图

Answer 5

升级到 Mac OS Catalina 后，将所有六个 dylib 文件复制到/usr/local/lib/不再有效（至少对我而言）。 为了找出正确的目的地是什么，我做了以下事情：

1. 打开错误堆栈树中引用的ctypes/__init__.py
2. 添加print(os.getcwd())以获取工作目录。 对我来说，工作目录是/Users/Username/GitHub/myproject
3. 由于 dylib 文件中的路径是相对于此路径 ( @executable_path/../lib/ )，因此 dylib 文件的正确目标是/Users/Username/lib

Answer 6

我不是 Mac 用户，但你真的在使用 Python 3.6 吗？ savReaderWriter 是否支持该版本？ 我怀疑它使用的 I/O 模块是为那个版本构建的。

如果这通过终端而不是 IDE 工作，请检查 Python 搜索路径是否相同。