从 [包] 导入 [功能] 在 R

Question

使用 Python 或 R 中的数据，我们经常加载多个包。 在某些情况下，两个包（例如foo和bar ）可能每个都包含一些 function （例如do_stuff ）。

在 Python 中进行管理以防止歧义或意外的方式如下：

from foo import do_stuff
from bar import other_function    # (does not load/import do_stuff() from bar)

在 R 中，我看到的所有代码都只是使用多个library(package_name)语句导入整个包。 我认为这会导致非常难以捕获的错误。 例如，参见Reordering factor gives different results, depending on which packages are loaded 。 事实上，即使“没有屏蔽，因为 reorder.factor 不存在于基础中”，这也会发生。

我希望这个问题的一般答案类似于上面的from package import function代码，但事实并非如此。 事实上，接受的（也是唯一的）答案只是解释了问题存在的原因（而不是淡化该贡献）。 答案的评论中提供了一个解决方法，但该解决方法特定于该特定的 function（ reorder ）。

有没有一种通用的方法可以从 R 中的特定 package 导入特定的 function？ 这样我就可以慎重而明确地知道我代码中所有 function 调用的来源，并确保它们按照我认为的方式进行？

Answer 1

从 R 4.0 开始，您还可以使用主library() function 执行此操作：

library(dplyr, include.only = c("select", "mutate"))
library(dplyr, exclude = c("filter", "lag"))

Answer 2

您可以使用package::function()构造明确告诉R哪个包应该用于给定的函数。 您甚至可以使用它来从未加载library包中调用函数。

library(dplyr) # Has a function called filter()
library(plyr) # Also has a filter() function

dplyr::filter(foo)
plyr::filter(bar)

如果你想确保最大限度地减少代码混淆的可能性，我强烈推荐使用conflicted包，这会强制你明确识别所有模糊函数调用的包： https ： //www.tidyverse.org/articles / 2018/06 /冲突/

Answer 3

您正在比较两种功能不同的语言。 首先，您可以使用::轻松地从包中引用函数，例如：

fortunes::fortune()

从fortunes包中调用fortune功能。

但你也必须小心这样做。 因为取决于包的构造方式，最终可能会使用依赖于命名空间中的其他（非导出）函数的函数，但由于未加载命名空间，因此无法找到该函数。 我自己使用例如mgcv包的绘图功能遇到了这个问题。 这是使用library()附加包的一个原因，正如Andrew Breza在他的回答中所说明的那样。 至少使用:: construct调用的函数将按预期工作（99.9％的时间）。

但是你链接的问题不会被解决。 问题是“糟糕的设计”，包装作者认为他需要一种S3方法来重新排序因子而不是特定于他的包的类。 这样做为整个因子类注册了一个S3方法，因此改变了在一个因子上调用reorder()的每个函数的行为。

由于这个问题是由软件包开发人员自己造成的，除了自己黑客入侵S3系统以找到所需的实际方法之外，你几乎无法做到这一点。

Answer 4

虽然这个答案是正确的，但它对于诸如magrittr的%>%和%$%缀运算符magrittr 。 import包有效：

import::from(magrittr, "%$%")

但显然可以用于任何功能：

import::from(foo, "do_stuff", "do_other_stuff")

请注意“[ import ]不适合与library一起使用。它的命名是为了调用import::from(pkg, fun1, fun2)这样的调用。” 有关详细信息，请参阅https://CRAN.R-project.org/package=import 。

Answer 5

基于 wjchulme 的回答，导入 package 还允许您从自己的脚本中导入函数或其他对象，使 R 具有模块化的感觉，很像 python 模块。

import::from(your_script.R, some_function, SOME_CONSTANT, and_whatever)

参考： https://cran.r-project.org/web/packages/import/vi.nettes/import.html