R如何安装软件包'graph'？

Question

包graph不再适用于CRAN。 我发现它已转移到Bioconductor，见

Bioconductor - 图表

但实际上，如果我尝试运行他们建议运行的命令

install.packages("BiocInstaller")
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")

我得到的错误是即使BiocInstaller也没有最新的R版本3.4.2

我该如何安装这个包？

Answer 1

看看这是否有效：

首先，从http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html下载zip文件

其次，在本地安装包：

install.packages("yourpath/graph_1.56.0.zip",repos=NULL)

然后， library(graph)将加载包。 您将获得一个警告消息，该包是在不同版本的R上创建的，但它可能会以这种方式工作。

Answer 2

不要使用此命令： install.packages("BiocInstaller")

此页面穿越Biconductor版本到R版本https://www.bioconductor.org/about/release-announcements/

> Release   R
> 3.7, 3.8  3.5
> 3.5, 3.6  3.4
> 3.3, 3.4  3.3

对于R 3.4.2，您需要Bioconductor 3.6 https://www.bioconductor.org/packages/3.6/bioc/html/graph.html

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")

Answer 3

请参阅http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html上的说明：

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.5”）并输入：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("graph", version = "3.8")