R如何安裝軟件包'graph'？

Question

包graph不再適用於CRAN。 我發現它已轉移到Bioconductor，見

Bioconductor - 圖表

但實際上，如果我嘗試運行他們建議運行的命令

install.packages("BiocInstaller")
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")

我得到的錯誤是即使BiocInstaller也沒有最新的R版本3.4.2

我該如何安裝這個包？

Answer 1

看看這是否有效：

首先，從http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html下載zip文件

其次，在本地安裝包：

install.packages("yourpath/graph_1.56.0.zip",repos=NULL)

然后， library(graph)將加載包。 您將獲得一個警告消息，該包是在不同版本的R上創建的，但它可能會以這種方式工作。

Answer 2

不要使用此命令： install.packages("BiocInstaller")

此頁面穿越Biconductor版本到R版本https://www.bioconductor.org/about/release-announcements/

> Release   R
> 3.7, 3.8  3.5
> 3.5, 3.6  3.4
> 3.3, 3.4  3.3

對於R 3.4.2，您需要Bioconductor 3.6 https://www.bioconductor.org/packages/3.6/bioc/html/graph.html

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("graph")

Answer 3

請參閱http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html上的說明：

安裝

要安裝此軟件包，請啟動R（版本“3.5”）並輸入：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("graph", version = "3.8")