Python中的生命线布尔索引与维度0上的索引数组不匹配； 维度为88，但相应的布尔维度为76

Question

这一段非常简单的代码，

# imports...
from lifelines import CoxPHFitter
import pandas as pd

src_file = "Pred.csv"

df = pd.read_csv(src_file, header=0, delimiter=',')
df = df.drop(columns=['score'])

cph = CoxPHFitter()
cph.fit(df, duration_col='Length', event_col='Status', show_progress=True)

产生一个错误：

追溯（最近一次通话最近）：文件“ C：/ Users /.../ predictor.py”，第11行，位于cph.fit（df，duration_col ='Length'，event_col ='Status'，show_progress = True）

文件“ C：\\ Users \\ ... \\ AppData \\ Local \\ conda \\ conda \\ envs \\ hrpred \\ lib \\ site-packages \\ lifelines \\ fitters \\ coxph_fitter.py”，第298行，适合自己。_check_values（df）

文件“ C：\\ Users \\ ... \\ AppData \\ Local \\ conda \\ conda \\ envs \\ hrpred \\ lib \\ site-packages \\ lifelines \\ fitters \\ coxph_fitter.py”，第323行，在_check_values cols = str（list（X .columns [low_var]））

文件“ C：\\ Users \\ ... \\ AppData \\ Local \\ conda \\ conda \\ envs \\ hrpred \\ lib \\ site-packages \\ pandas \\ core \\ indexes \\ base.py”，行1754，在_ _ getitem _ _中

结果= getitem（键）

IndexError：布尔索引与维度0上的索引数组不匹配； 维度为88，但相应的布尔维度为76

但是，当我打印df本身时，一切都很好。 如您所见，所有内容都在库中。 图书馆的例子很好用。

Answer 1

不知道您的数据是什么样子-我遇到了相同的错误，当我从使用的df熊猫中删除了除持续时间，事件和系数以外的所有错误时，该错误得以解决。 就是说，我在df中有很多额外的列，这些列会混淆cox PH拟合器，因为您实际上并未指定要包含哪个coef作为cph.fit（）的参数。