R 中 system() 和 system2() 的区别？ 在变量中捕获文件名

Question

在 R 中，我想列出目录中的文件，并捕获输出，但是 R 有两个对系统的调用：system() 和 system2()。 我很好奇有什么区别，如果有的话，更重要的是如何使用它们。 我找到了一些页面，包括这里和这里，但我想在这里放一些例子，以及我在使用 system2() 时遇到的错误，包括：

sh: 1: ls /home : 未找到

Answer 1

在研究之前，我的第一次尝试都是在system() ，因为我不知道system2() 。 我决定在system2()重做我的方法以实现可移植性（我在 Linux 系统上工作）。 这让我发现了一些差异。

首先， system()解决方案列出文件并将输出保存在变量中：

gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system(paste("ls", gseaDirectory, sep=" "), intern=T)

这将我的主目录所在的字符串“/home”存储到变量 gseaDirectory 中。 然后我能够将命令ls 、一个空格、 sep=" "和我的目录变量gseaDirectory到一个 linux 命令中，以列出所选目录中的所有文件：

ls /home

然后将文件列表保存在变量 "filenames" 中，并添加了 system() 参数intern=T 。

这在 system2() 中不起作用，只会返回错误：

sh: 1: ls /home : 未找到

我们相同的方法略有变化，等效的system2()命令是：

gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system2('ls',  paste(gseaDirectory, sep=" "), stdout = TRUE)

system2 中的第一项是命令，然后是目标文件，然后是stdout=T ，它告诉 R 我们将把输出存储到一个变量中，否则我们的命令的结果将被打印而不是保存。

希望这可以帮助某人！