[英]Submitting LSF job array using different arguments for each element of the array
我试图避免提交单独的工作。 到目前为止,我在脚本的开头已经有了以下内容:
#!/bin/bash
#BSUB -P account
#BSUB -q queue
#BSUB -W 48:00
#BSUB -n 2
#BSUB -R rusage[mem=40000]
#BSUB -J jobname[1-22]
#BSUB -a 000-176:1
#BSUB -eo jobname.%I.%a.err
#BSUB -oo jobname.%I.%a.out
然后提交作业,如下所示:
bsub < myscript.sh
我也尝试了-i
选项,但这也不起作用。
另一个问题是,对于数组的不同元素,输入参数的范围是不同的。 因此,对于jobname [1],输入参数的范围为000-176,但对于jobname [22],输入参数的范围为000-067。
有没有一种方法可以不手动提交作业22次或更多次?
在脚本中使用$LSB_JOBINDEX
环境变量,该变量在执行时设置为特定数组元素的索引号。
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