如何在networkx间接图中绘制循环边

Question

我有以下图表：

graph = {("A","A"): 3, ("A","B"): 4, ("A","C"): 1}

我试图绘制一个图表，显示一个标有数字3的节点（“A”）中的循环。循环应该看起来像这里的节点（1）。

它必须是一个间接图。

到目前为止我使用这个：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()

for edge in graph:
    G.add_edge(edge[0], edge[1])
graph_pos=nx.shell_layout(G)
nx.draw_networkx_nodes(G,graph_pos)
nx.draw_networkx_edges(G,graph_pos)
nx.draw_networkx_labels(G, graph_pos)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, graph_pos, edge_labels = graph)

plt.show()

输出是：

如您所见，即使存在边缘（“A”，“A”），节点“A”周围也没有循环。 关于如何实现这一点的任何想法？

编辑 - 为什么不重复？

问题Matplotlib和Networkx - 绘制一个自循环节点用于有向图。 使用G=nx.MultiDiGraph创建图形时，可以使用G.graph['edge']设置边的属性。

使用nx.Graph() （间接图）， G.graph['edge']是一个空字典。

这个问题与这个问题的区别在于，我使用的是nx.Graph而且该问题使用的是nx.MultiDiGraph 。

Answer 1

从我收集的内容来看，networkx的绘制功能并没有做任何努力来绘制自循环。 让我这么说的是：如果你改变你的脚本

    import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
graph = {("A","A"): 3, ("A","B"): 4, ("A","C"): 1}
#graph = {("A","B"): 4, ("A","C"): 1}
for edge in graph:
    G.add_edge(edge[0], edge[1])
graph_pos=nx.circular_layout(G)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, graph_pos, edge_labels = graph)
nx.draw_networkx_nodes(G,graph_pos, alpha=0.1)
nx.draw_networkx_edges(G,graph_pos)
#nx.draw_networkx_labels(G, graph_pos)


plt.show()

您会注意到边缘标签已显示。 在Networkx中，似乎边缘只是顶点之间的线条。 同一点之间的界线很好......没什么......

所以我认为你对networkx没有好运。

然而，使用pygraphviz是Matplotlib和Networkx中建议的最佳选择- 绘制自循环节点

从我的知识graphviz （警告它只有32位）（和它的python包装pygraphviz需要graphviz）仍然是一个非常好的图形可视化器。

安装后，您可以使用networkx.drawing.nx_agraph的to_agraph函数。

祝好运。

Answer 2

PE Normand的回答让我看看graphviz ，我意识到，如果我将有向图的arrowsize更改为0，它看起来像是一个间接图。 使用它我可以重用Matplotlib和Networkx中的答案- 绘制一个自循环节点 ，但我仍然没有标签边缘。 在这里使用答案我设法创建以下图表：

import networkx as nx
from networkx.drawing.nx_agraph import to_agraph

graph = {("A","A"): 3, ("A","B"): 4, ("A","C"): 1}
G=nx.MultiDiGraph()

# add edges
for edge in graph:
    G.add_edge(edge[0], edge[1])

# arrow size: '0' makes it look like an indirected graph
G.graph['edge'] = {'arrowsize': '0', 'splines': 'curved'}
G.graph['graph'] = {'scale': '3'}

A = to_agraph(G)
A.layout('dot')

# set edge labels
for pair in graph:
    edge = A.get_edge(pair[0], pair[1])
    edge.attr['label'] = str(graph[pair]) + "  "

A.draw('test.png')

这是图表：

这个答案可能与有向图的问题重复，我仍然认为值得与间接图的小调整保持一致。