在 R 中的两个不同长度的向量中查找匹配值

Question

我有两个带有物种名称的向量，它们遵循两种不同的方法。 有些名称相同，有些名称不同，并且两者的排序方式不同。 一个例子：列表 1: c(Homo sapiens sapiens, Homo sapiens neanderthalensis, Homo直立人,...,n) 列表 2: c(Homo直立人, Homo sapiens, Homo neanderthalensis,...,n+1)

我写 n 和 n+1 来表示这些列表有不同的长度。

我想创建一个由两个值组成的新列表：在两个向量（例如直立人）之间存在匹配的情况下，我希望列表 2 的名称位于列表中名称所在的位置1，或者如果列表 1 中的位置不匹配“0”。所以在这种情况下，这个新列表将是 newlist: c(0,0, Homo直立人,...)

为此，我编写了以下代码，但它不起作用。

data<-read.table("species.txt",sep="\t",header=TRUE)
list1<-as.vector(data$Species1)
list2<-as.vector(data$Species2)
newlist<-as.character(rep(0,length(list1)))

for (i in 1:length(list1)){
for (j in 1:length(list2)){
if(list1[i] == list2[j]){newlist[i]<- list2[j]}else {newlist[i]= 0}
}
}

我希望这很清楚。

谢谢你的帮助！

Answer 1

以这个可重现的例子为例：

set.seed(1)
list1 <- letters[1:10]
list1names
list2 <- letters[sample(1:10, 10)]

您可以使用ifelse避免循环：

newlist <- ifelse(list1==list2, list2, 0)

问题是你没有声明newname ，你的意思是newlist吗？

如果要使用循环，则只能使用一个循环而不是 2 个循环，因为length(list1) = length(list2) ：

for (i in 1:length(list1)){
    if(list1[i] == list2[i]){newlist[i]<- list2[i]}else {newlist[i]= 0}
}

一般来说，如果你想匹配向量中的元素，你可以像这样使用match ：

> list1
 [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j"
> list2
 [1] "c" "d" "e" "g" "b" "h" "i" "f" "j" "a"
> match(list1, list2)
 [1] 10  5  1  2  3  8  4  6  7  9

如您所见， match获取list2中元素的索引，这些索引等于list1的元素。 如果您有另一个表data2 ，并且您想从data2$list3 data$list1 中获取对应元素的 data2 中的列，这很有用，您可以使用：

data <- data.frame(list1, list2)
list3 <- list2
columntoget <- 1:length(list2)
data2 <- data.frame(list3, columntoget)
data$mynewcolumn <- data2$columntoget[match(data$list1, data2$list3)]
> data$mynewcolumn
 [1] 10  5  1  2  3  8  4  6  7  9

Answer 2

我不完全确定我了解您想要实现的目标，但我认为这可以满足您的需求。

list1 <- c("Homo sapiens sapiens","Homo sapiens neanderthalensis","Homo erectus")
list2 <- c("Homo erectus","Homo sapiens","Homo neanderthalensis")

sapply(list1, function(x) { ifelse(x %in% list2, list2[which(list1 == x)], 0) } )

Answer 3

内部 for 循环使用newname[i] ，它应该是newlist[i] 。 使用您的代码，您可以使用0或物种名称覆盖newlist[i]条目j次。 这可能不是您想要的。