在 R 中的兩個不同長度的向量中查找匹配值

Question

我有兩個帶有物種名稱的向量，它們遵循兩種不同的方法。 有些名稱相同，有些名稱不同，並且兩者的排序方式不同。 一個例子：列表 1: c(Homo sapiens sapiens, Homo sapiens neanderthalensis, Homo直立人,...,n) 列表 2: c(Homo直立人, Homo sapiens, Homo neanderthalensis,...,n+1)

我寫 n 和 n+1 來表示這些列表有不同的長度。

我想創建一個由兩個值組成的新列表：在兩個向量（例如直立人）之間存在匹配的情況下，我希望列表 2 的名稱位於列表中名稱所在的位置1，或者如果列表 1 中的位置不匹配“0”。所以在這種情況下，這個新列表將是 newlist: c(0,0, Homo直立人,...)

為此，我編寫了以下代碼，但它不起作用。

data<-read.table("species.txt",sep="\t",header=TRUE)
list1<-as.vector(data$Species1)
list2<-as.vector(data$Species2)
newlist<-as.character(rep(0,length(list1)))

for (i in 1:length(list1)){
for (j in 1:length(list2)){
if(list1[i] == list2[j]){newlist[i]<- list2[j]}else {newlist[i]= 0}
}
}

我希望這很清楚。

謝謝你的幫助！

Answer 1

以這個可重現的例子為例：

set.seed(1)
list1 <- letters[1:10]
list1names
list2 <- letters[sample(1:10, 10)]

您可以使用ifelse避免循環：

newlist <- ifelse(list1==list2, list2, 0)

問題是你沒有聲明newname ，你的意思是newlist嗎？

如果要使用循環，則只能使用一個循環而不是 2 個循環，因為length(list1) = length(list2) ：

for (i in 1:length(list1)){
    if(list1[i] == list2[i]){newlist[i]<- list2[i]}else {newlist[i]= 0}
}

一般來說，如果你想匹配向量中的元素，你可以像這樣使用match ：

> list1
 [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j"
> list2
 [1] "c" "d" "e" "g" "b" "h" "i" "f" "j" "a"
> match(list1, list2)
 [1] 10  5  1  2  3  8  4  6  7  9

如您所見， match獲取list2中元素的索引，這些索引等於list1的元素。 如果您有另一個表data2 ，並且您想從data2$list3 data$list1 中獲取對應元素的 data2 中的列，這很有用，您可以使用：

data <- data.frame(list1, list2)
list3 <- list2
columntoget <- 1:length(list2)
data2 <- data.frame(list3, columntoget)
data$mynewcolumn <- data2$columntoget[match(data$list1, data2$list3)]
> data$mynewcolumn
 [1] 10  5  1  2  3  8  4  6  7  9

Answer 2

我不完全確定我了解您想要實現的目標，但我認為這可以滿足您的需求。

list1 <- c("Homo sapiens sapiens","Homo sapiens neanderthalensis","Homo erectus")
list2 <- c("Homo erectus","Homo sapiens","Homo neanderthalensis")

sapply(list1, function(x) { ifelse(x %in% list2, list2[which(list1 == x)], 0) } )

Answer 3

內部 for 循環使用newname[i] ，它應該是newlist[i] 。 使用您的代碼，您可以使用0或物種名稱覆蓋newlist[i]條目j次。 這可能不是您想要的。