Python networkx 图标签

Question

我有两个数据框，用于在 Python 中使用 networkx 创建图形。 数据帧 df1（节点坐标）和 df2（边缘信息）如下所示：

    location     x      y
0   The Wall     145    570
2   White Harbor 140    480

和

    location    x             y 
56  The Wall    Winterfell    259 
57  Winterfell  White Harbor  247 

这是我为尝试绘制它而实现的代码：

plt.figure()
G=nx.Graph()

for i, x in enumerate(df1['location']):
  G.add_node(x, pos=(df1['x'][i], df1['y'][i]))

for x, x2, w in zip(df2['location'], df2['x'], df2['y']):
  G.add_edge(x, x2, weight=w)

plt.figure(figsize=(15,15)) 

pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
weights = nx.get_edge_attributes(G, 'weight') 
nx.draw(G, pos=pos, node_size=40, with_labels=True, fontsize=9)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos=pos, edge_labels=weights)

plt.show()

我之前运行过几次，它似乎有效，但是现在重新打开 jupyter notebook 并再次运行后，它不起作用。 我主要有两个主要问题。

• 如果我尝试只运行nx.draw(G, pos=pos, node_size=40, with_labels=True, fontsize=9) ，我的图形将显示，但不会显示任何标签，即使 with_labels 设置为 true。
• 其次，这一行nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos=pos, edge_labels=weights)现在向我展示了错误不能将序列乘以非 int 类型的“float”

我已经看了几个小时了，我似乎无法解决它，有什么想法吗？

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编辑：如果从 nx.draw 中排除 pos=pos，我可以让标签显示出来，但如果我包含它，它将不起作用

Answer 1

问题是您没有为节点Winterfell指定任何pos属性，然后当您尝试在draw_networkx_edge_labels访问它时，它找不到它。

如果您尝试给它一个位置属性，请说：

      location    x    y
0      TheWall  145  570
1   Winterfell  142  520
2  WhiteHarbor  140  480

然后可以正确访问所有节点的属性并正确绘制网络：

plt.figure()
G=nx.Graph()

df1 = df1.reset_index(drop=True)
df2 = df2.reset_index(drop=True)

for i, x in enumerate(df1['location']):
    G.add_node(x, pos=(df1.loc[i,'x'], df1.loc[i,'y']))

for x, x2, w in zip(df2['location'], df2['x'], df2['y']):
    G.add_edge(x, x2, weight=w)

plt.figure(figsize=(15,15)) 

pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
weights = nx.get_edge_attributes(G, 'weight') 
nx.draw(G, pos=pos, node_size=40, with_labels=True, fontsize=9)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos=pos, edge_labels=weights)

plt.show()