如何使用 bash 脚本在 conda env 中运行 atom 和氢？

Question

我曾经有一个简单的 bash 脚本，用于激活 conda env 然后运行 ​​atom。 然后，我可以使用氢运行 python 代码，它可以自动查看 myenv 中的包。

之前的 bash 脚本是这样的：

#!/bin/bash

source activate myenv && 
atom

由于 conda > 4.4 不再存在“源激活”，我不得不将脚本修改为：

#!/bin/bash

source /home/ubuntu/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh &&
conda activate myenv &&
atom

但是，氢不再检测 myenv 并从基础 env 运行代码，这会由于基础 env 中缺少包而导致错误。

当我用 spyder 替换 atom 时，上面的脚本工作正常并且 spyder 内核确实看到了 myenv。

知道如何解决这个问题吗？

更新 1：

我做了更多的调试。 看来我的ipykernel没有分配给激活环境中安装的内核，而是分配给了默认的ipykernel。

当我在我的激活环境中尝试jupyter kernelspec list时，我得到：

python3    /home/ubuntu/.local/share/jupyter/kernels/python3

但在另一个系统上，我得到

/home/ubuntu/miniconda3/envs/myenv/share/jupyter/kernels/python3

这似乎是正确的内核。

关于如何解决这个问题的任何想法？

更新 2：

看来，这解决了更新1中的问题，那么，我能在ENV使用公认的答案负载原子所需的ENV中，并有氢跑从ipykernel。

Answer 1

source activate仍然像以前一样工作，尽管它不再是激活环境的首选方式。

如果您只运行一个命令，请尝试

conda run -n <envname> <command>

可能首先采购配置文件。

我还没有尝试过，但一个潜在的问题是您在获取配置文件后使用&& 。 我假设当你写这个问题时，行继续符（ \\ ）在那里丢失了。 只需将命令写入单独的行，以便在bash 处理下一个命令之前加载配置文件。