将列名分配给df，阻止字符自动转换为数字？

Question

我有一个 df 的基因名称和一个 df 的这些基因的值。 我想将两者结合起来（用基因名称标记数据框）。

我有一个 1x23000 df，“基因”：

AB1G, A1CF, ..., ZYY1

和一个 8000x23000 df，“表达式”：

1 0... 3

0 0... 1

2 2... 0

我想将它们组合成一个df：

A1BG A1CF... ZYY1

1 0... 3

0 0... 1

2 2... 0

当我使用 rbind 时，基因名称保持不变，但“表达式”中的所有非零值都变为 N/A。

当我使用 colnames(expression)=genes 或 colnames(expression)=paste(genes) 时，表达式编号保持不变，但基因名称被转换为看似无意义的数字。

经过进一步调查，我发现“基因”的结构出于某种原因是“因子”——当我使用 as.character 进行转换时，所有基因都被重新分配，看起来像是一个随机数（AB1G 现在是 1143，A1CF 现在是 967， ETC）。

我认为基因和表达dfs的格式不兼容可能存在问题。 如何将字符列名称添加到数字 df？

Answer 1

出现数值而不是字符串的问题是因为列是factor s，并且当它被强制转换为 integer 存储模式值时。 相反，我们可以在 unlisting 后转换为character unlist或转换为自动将 class 转换为character的matrix ，然后使用c删除dim属性（转换为vector ）

 colnames(expression) <- as.character(unlist(genes))

或者

colnames(expression) <- c(as.matrix(genes))