將列名分配給df，阻止字符自動轉換為數字？

Question

我有一個 df 的基因名稱和一個 df 的這些基因的值。 我想將兩者結合起來（用基因名稱標記數據框）。

我有一個 1x23000 df，“基因”：

AB1G, A1CF, ..., ZYY1

和一個 8000x23000 df，“表達式”：

1 0... 3

0 0... 1

2 2... 0

我想將它們組合成一個df：

A1BG A1CF... ZYY1

1 0... 3

0 0... 1

2 2... 0

當我使用 rbind 時，基因名稱保持不變，但“表達式”中的所有非零值都變為 N/A。

當我使用 colnames(expression)=genes 或 colnames(expression)=paste(genes) 時，表達式編號保持不變，但基因名稱被轉換為看似無意義的數字。

經過進一步調查，我發現“基因”的結構出於某種原因是“因子”——當我使用 as.character 進行轉換時，所有基因都被重新分配，看起來像是一個隨機數（AB1G 現在是 1143，A1CF 現在是 967， ETC）。

我認為基因和表達dfs的格式不兼容可能存在問題。 如何將字符列名稱添加到數字 df？

Answer 1

出現數值而不是字符串的問題是因為列是factor s，並且當它被強制轉換為 integer 存儲模式值時。 相反，我們可以在 unlisting 后轉換為character unlist或轉換為自動將 class 轉換為character的matrix ，然后使用c刪除dim屬性（轉換為vector ）

 colnames(expression) <- as.character(unlist(genes))

或者

colnames(expression) <- c(as.matrix(genes))