计算R中矩阵各列之间的相关性

Question

我在 R 中有以下矩阵mat ：

      x  y  z
rowA -1  1  2
rowB -1 -2 -1
rowC  2  1 -1

如何计算矩阵各列（例如corr(x, y) 、 corr(y, z) 、 corr(x, z) ）之间的相关性，而不是将列分成向量？

Answer 1

你可以做：

#gives pairwise
COR = cor(M)
# to get 1 vs 2, 1 vs 3 and 2 vs 3
COR[upper.tri(COR)]

Answer 2

我们可以使用combn创建一次取 2 个列名的组合，从矩阵中子集组合，然后计算它们之间的相关性。

combn(colnames(mat), 2, function(x) cor(mat[, x[1]], mat[, x[2]]))
#[1]  0.5 -0.5  0.5

数据

mat <- structure(c(-1L, -1L, 2L, 1L, -2L, 1L, 2L, -1L, -1L), .Dim = c(3L, 
3L), .Dimnames = list(c("rowA", "rowB", "rowC"), c("x", "y", "z")))

Answer 3

底座 R：

cor_df <- data.frame(vars = row.names(cor(mat)), cor(mat), row.names = NULL)