計算R中矩陣各列之間的相關性

Question

我在 R 中有以下矩陣mat ：

      x  y  z
rowA -1  1  2
rowB -1 -2 -1
rowC  2  1 -1

如何計算矩陣各列（例如corr(x, y) 、 corr(y, z) 、 corr(x, z) ）之間的相關性，而不是將列分成向量？

Answer 1

你可以做：

#gives pairwise
COR = cor(M)
# to get 1 vs 2, 1 vs 3 and 2 vs 3
COR[upper.tri(COR)]

Answer 2

我們可以使用combn創建一次取 2 個列名的組合，從矩陣中子集組合，然后計算它們之間的相關性。

combn(colnames(mat), 2, function(x) cor(mat[, x[1]], mat[, x[2]]))
#[1]  0.5 -0.5  0.5

數據

mat <- structure(c(-1L, -1L, 2L, 1L, -2L, 1L, 2L, -1L, -1L), .Dim = c(3L, 
3L), .Dimnames = list(c("rowA", "rowB", "rowC"), c("x", "y", "z")))

Answer 3

底座 R：

cor_df <- data.frame(vars = row.names(cor(mat)), cor(mat), row.names = NULL)