未定义符号：使用 numpy 和 swig 时的 PyArray_API

Question

我试图用 Swig 在 Python 中包含一些用 C 编写的代码。 目的是在 Python 中创建 numpy arrays 并在 Z0D61F8370 中将它们用作指向 CAD1D412F5Z22 的指针。

这是代码：

在 Swig 中：

%apply (int DIM1, double* INPLACE_ARRAY1) {(int n, double* x)} extern void f(int n, double* x);

在 C 中：

void f(int n, double* x)

不幸的是，当我尝试加载模块时，我收到以下错误消息：

ImportError: _test.so: undefined symbol: PyArray_API

谢谢！

Answer 1

我们需要更多关于如何构建/链接它的详细信息。 根据可用信息，我最好的猜测是，由于 SWIG 不支持 C（我知道有一个 fork），但您的其他代码是，您将最终模块库与 C 编译器链接，而不是 ZF6F897C9FDCF8EEB3C2F

这是一个基本的工作示例（假设您将 numpy.i 复制到本地目录）。 首先， fun.i ：

%module fun

%{
#include "f.h"
%}

%include "numpy.i"

%init %{
import_array();
%}

%apply (int DIM1, double* INPLACE_ARRAY1) {(int n, double* x)}
extern void f(int n, double* x);

然后fh ：

#include "numpy/arrayobject.h"

extern "C" void f(int n, double* x);

大口喝水：

$ swig -python -c++ fun.i

编译你的 f.c 实现（你没有提供；C 编译器很好），然后链接：

$ g++ -O2 -o _fun.so -shared fun_wrap.cxx f.o `python3-config --includes` -fPIC -I`python -c 'import numpy; print(numpy.get_include())'` -Wno-cpp

并使用：

>>> import fun
>>> import numpy as np
>>> x = np.array(range(10), dtype=np.double)
>>> fun.f(x)
>>>

所以现在，如果我检查nm _fun.so | grep PyArray_API nm _fun.so | grep PyArray_API ，我得到：

0000000000009740 b _ZL11PyArray_API

所以它在数据部分中，而不是要解析的符号，但请注意，名称已损坏，因此只能由 C++ 解析。

编辑：（如以下评论中所述。）

numpy 的 _multiarray_umath 子模块中有一个强大的 PyArray_API 数据符号（无论如何在我的系统上）。 我不认为以下是解决方案，但它可能有助于找出问题所在，原则上，“import_array”部分应该处理相同的问题。

比较这个结果：

>>> import numpy
>>> import fun # the SWIG module, test in your case I think

与此相比：

>>> import numpy.core._multiarray_umath as um
>>> import ctypes
>>> h = ctypes.CDLL(um.__file__,  ctypes.RTLD_GLOBAL)
>>> import fun # or import test if that's the name

这可能表明它对我有用而不对你有用的原因是由于我们各自的 numpy 安装的差异。 （两者都为我工作。）