在 miniconda 环境中未找到模块错误 Bio

Question

我将 bio python 安装为

pip install biopython以及conda install -c conda-forge biopython 。 我在站点包中看到。 出于某种原因，存在Bio依赖性。 如何解决这种依赖性？

 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import bio
>>> bio.__version__
'1.75'
>>> from bio import pairwise2
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File ".../miniconda/lib/python3.7/site-packages/bio/pairwise2.py", line 246, in <module>
    from Bio import BiopythonWarning
ModuleNotFoundError: No module named 'Bio'
>>> 

Answer 1

显然，重命名bio作为Bio在sitepackages那么它的工作原理

Python 3.7.4 (default, Aug 13 2019, 15:17:50) 
[Clang 4.0.1 (tags/RELEASE_401/final)] :: Anaconda, Inc. on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import Bio
>>> from Bio import pairwise2
>>> 

Answer 2

我在谷歌上搜索过如何在这个链接中使用 pip 安装 biopython。

1. 您需要输入pip install biopython或pip install biopython --user

2. 然后导入Bio（是B不是b）

import Bio
print(Bio.__version__) 

我确信文档总是一个好的开始，你可以在这里找到。