如果使用覆盖文本，则不显示 R ggplot2 geom_smooth line

Question

当省略 aes(text) 时，我只能在 ggplot 或 plotly 中显示回归线。 显示工具提示文本或回归线，但不能同时显示。 我真的很困惑为什么，因为 ggplot/ggplotly 没有警告或错误。

Dataframe：

sum(is.na(cdata2))
[1] 0

str(cdata2)
'data.frame':   2508 obs. of  7 variables:
 $ POPESTIMATE2019: num  55869 223234 24686 22394 57826 ...
 $ ST             : chr  "AL" "AL" "AL" "AL" ...
 $ pdensity       : num  93 140 27 35 89 16 25 187 55 47 ...
 $ STC            : chr  "Alabama-Autauga" "Alabama-Baldwin" "Alabama-Barbour" "Alabama-Bibb" ...
 $ tcases         : int  132 264 92 51 47 58 301 136 329 30 ...
 $ tdeaths        : int  4 8 1 1 1 1 10 3 22 0 ...
 $ SAHdate        : Date, format: "2020-04-04" "2020-04-04" "2020-04-04" "2020-04-04" ...

s <- ggplot(cdata2, aes(x = pdensity,
                        y = tcases,
                        size = tdeaths,
                        color = SAHdate,
                        text=paste0(
                          "<br>St-County: ",STC,
                          "<br>Pop: ",POPESTIMATE2019,
                          "<br>Tot Cases: ",tcases,
                          "<br>People/sq mile: ", pdensity,
                          "<br>Tot Deaths: ", tdeaths))) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method = "lm", na.rm = TRUE, inherit.aes = TRUE);s

结果是没有回归线。

如果我注释掉文本部分：

s <- ggplot(cdata2, aes(x = pdensity,
                        y = tcases,
                        size = tdeaths,
                        color = SAHdate)
  geom_point() +
  geom_smooth(method = "lm", na.rm = TRUE, inherit.aes = TRUE);s

回归线如图所示：

我尝试使用 plotly 使用大量变体：

fit <- lm(tcases~pdensity, data=cdata2)
ggplotly(s) %>%
 add_trace(x = ~pdensity, y = ~fitted(fit),data = cdata2,mode = 'lines') %>%
 add_lines(x = ~pdensity, y = ~fitted(fit),data = cdata2,mode = 'lines')

`geom_smooth()` using formula 'y ~ x'
Error in min(x, na.rm = na.rm) : invalid 'type' (list) of argument

我难住了！

Answer 1

我无法确切回答您为什么会出现这种行为，但您是正确的，而且……这很奇怪。 我用一个简单的例子做了一些侦探工作： df <- data.frame(x=1:1000, y=rexp(1000)) 。 我调整了全局aes()术语，寻找线条何时消失。 结果如下：

g <- list(geom_point(), geom_smooth())

ggplot(df, aes(x,y)) + g  # control
ggplot(df, aes(x,y, text=x)) + g  # OK
ggplot(df, aes(x,y, text='x')) + g   # OK
ggplot(df, aes(x,y, text=paste(x))) + g  # NO LINE SHOWN

解决方法已经在您的代码中，即在geom_smooth()中设置inherit.aes=FALSE 。 无论出于何种原因，它都不喜欢在text=美学中使用paste() 。 这意味着您必须在geom_smooth中重申您的x和y美学，但它工作正常：

ggplot(df, aes(x,y, text=paste(x))) +
    geom_point() + geom_smooth(inherit.aes = FALSE, aes(x,y))

Answer 2

我尝试在geom_point()中移动 "text=..." ，如下所示：

p = p + geom_point(aes(text = paste("ID ",sampleID))

虽然它会发出警告消息，但当我生成plotly时：

ggplotly(p)

它成功了。