Python 请求：上传文件并随后解析来自重定向的数据

Question

我正在尝试使用此在线转换器将 PDB（蛋白质数据库格式）文件转换为 SMILES 字符串（分子的表示）： https://cactus.nci.nih.gov/translate/

当您提交 PDB 文件并按下“翻译”按钮时，它会重定向到带有 SMILES 字符串的新 url。 如何使用请求从重定向的 url 解析 output SMILES 字符串？ 所有选项都可以保持默认。 到目前为止我已经尝试过：

import requests

url='https://cactus.nci.nih.gov/translate/'

with open("MTK.pdb", "rb") as file:
    pdbfile = {'pdb': file}
    r = requests.post(url, files=pdbfile, allow_redirects=True)

但它只是一直给我主页。 提前致谢。

可能重复： 上传文件并处理重定向 [PYTHON]

编辑：有问题的pdb文件： https://pastebin.com/zBNtqR7K （另存为.pdb）

Answer 1

您发布到错误 url，并以错误的方式发布。

表格中的文件称为file 。并且不要忘记在data中添加一些额外的参数。否则它将收到500，

import requests

url = 'https://cactus.nci.nih.gov/cgi-bin/translate.tcl'

with open(r"xxx.pdb", "rb") as file:
    pdbfile = {'file': file}
    data = {
        "smiles":"C12C3C4C1C5C4C3C25",
        "format": "screen",
        "astyle": "kekule",
        "dim":"2D"
    }
    r = requests.post(url, files=pdbfile, data=data)
    print(r.text)

结果：

....
<FONT STYLE="Helvetica, Arial">
<B>CC(C)(O)C1=C(CCC(SCC2(CC2)CC(O)=O)C3=CC(=CC=C3)CCC4=NC5=CC(=CC=C5C=C4)Cl)C=CC=C1</B>
</FONT>
...