[英]Number of Connected Nodes in a dendrogram
最近刚开始使用 tidygraph 和 ggraph 包,遇到了一个相对简单的问题,但奇怪的是,似乎找不到简单的解决方案。 在一个网络中,有多少节点从单个父节点向下连接? 似乎是一个相当简单的问题,但一直在努力得出答案,尤其是当有多个“父/子”关系需要展开时。
# reproducible example -----------------
library(tidygraph)
library(ggraph)
library(tidyverse)
parent_child <- tribble(
~parent, ~child,
"a", "b",
"b", "c",
"b", "d",
"d", "e",
"d", "f",
"d", "g",
"g", "z"
)
# converted to a dendrogram ------------
parent_child %>%
as_tbl_graph() %>%
ggraph(layout = "dendrogram") +
geom_node_point() +
geom_node_text(aes(label = name),
vjust = -1,
hjust = -1) +
geom_edge_elbow()
我想知道的; 移出/向下时(忽略节点“a”)有多少个节点连接到点“b”? 我期望的答案是 6,或者,包括“b”,然后是 7。
我在大约 5000 个人的网络上运行它,所以按名称过滤单个节点不是一个很好的解决方案。 我办公室里没有其他人熟悉网络分析,所以我只能自己解决这个问题。 真的希望有人有见地! 同时将继续审查问题和可能的解决方案:) 谢谢大家!
一种方法是使用igraph
包中的ego_size()
。 它需要一个order
参数,但您可以使用边数来捕获邻域的最大可能顺序。
library(igraph)
g <- graph_from_data_frame(parent_child)
ego_size(g, order = ecount(g), nodes = "b", mode = "out", mindist = 1)
[1] 6
对于多个节点,只需传递感兴趣节点的向量:
ego_size(g, order = ecount(g), nodes = c("b", "d", "g"), mode = "out", mindist = 1)
[1] 6 4 1
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