[英]Number of Connected Nodes in a dendrogram
最近剛開始使用 tidygraph 和 ggraph 包,遇到了一個相對簡單的問題,但奇怪的是,似乎找不到簡單的解決方案。 在一個網絡中,有多少節點從單個父節點向下連接? 似乎是一個相當簡單的問題,但一直在努力得出答案,尤其是當有多個“父/子”關系需要展開時。
# reproducible example -----------------
library(tidygraph)
library(ggraph)
library(tidyverse)
parent_child <- tribble(
~parent, ~child,
"a", "b",
"b", "c",
"b", "d",
"d", "e",
"d", "f",
"d", "g",
"g", "z"
)
# converted to a dendrogram ------------
parent_child %>%
as_tbl_graph() %>%
ggraph(layout = "dendrogram") +
geom_node_point() +
geom_node_text(aes(label = name),
vjust = -1,
hjust = -1) +
geom_edge_elbow()
我想知道的; 移出/向下時(忽略節點“a”)有多少個節點連接到點“b”? 我期望的答案是 6,或者,包括“b”,然后是 7。
我在大約 5000 個人的網絡上運行它,所以按名稱過濾單個節點不是一個很好的解決方案。 我辦公室里沒有其他人熟悉網絡分析,所以我只能自己解決這個問題。 真的希望有人有見地! 同時將繼續審查問題和可能的解決方案:) 謝謝大家!
一種方法是使用igraph
包中的ego_size()
。 它需要一個order
參數,但您可以使用邊數來捕獲鄰域的最大可能順序。
library(igraph)
g <- graph_from_data_frame(parent_child)
ego_size(g, order = ecount(g), nodes = "b", mode = "out", mindist = 1)
[1] 6
對於多個節點,只需傳遞感興趣節點的向量:
ego_size(g, order = ecount(g), nodes = c("b", "d", "g"), mode = "out", mindist = 1)
[1] 6 4 1
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