如何使用tidyverse工具将矩阵读入R？

Question

请你帮助我好吗？

我经常需要将关联矩阵(AxB) 读入R格式的TXT文件。 它们看起来像这样：

matrix <- matrix(round(runif(50, 0, 100),0), 5, 10)

我通常的解决方案涉及 base 的read.delim和as.matrix ：

as.matrix(read.delim("matrix.txt", row.names = 1))

该文件被读取并转换为matrix类，因此可以进行适当的分析。

但是，我希望也能够使用tidyverse 的read_delim读取矩阵文件，因此对于大型矩阵或大量矩阵，读取过程可以更快。 我试过这个：

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "/t"))

但是数据以一种非常奇怪的格式被打乱，并且信息丢失了。 有没有办法使用tidyverse工具读取和处理关联matrices ？

谢谢！

Answer 1

在 R 中，您需要使用反斜杠来表示特殊字符和转义字符。

尝试

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "\t"))

read_delim函数没有 row.names 选项，因此您必须转换数据才能将行名作为行名（而不是第一列）。 您应该在转换为矩阵之前执行此操作。

library(tidyverse)
matrix <- read_delim("matrix.txt", delim = "\t") %>%
  column_to_rownames(first_column) %>%
  as.matrix()

Answer 2

尝试这个

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "\t", col_names = F))