R package 设计：如何将内部函数导出到集群

Question

我正在研究 R package，我需要使用parallel::parLapply在集群上运行 function myfun 。 myfun从我的 package 中调用了几个额外的函数，这些函数又调用了更多的函数，其中一些函数有多个方法……所以通过名称显式地将所有函数和方法传递给集群非常麻烦。

据我了解， 标准建议是运行parallel::clusterEvalQ({library("my_package")}) 。 但是对library("my_package")的调用显然是对 R-CMD-check 的厌恶。 而且我有理由相信my-package:::function也不会在 CRAN 上飞行。

这里的标准方法是什么？ 我是否需要按名称导出每个相关的 function 和方法？

Answer 1

好的，这似乎可行，（它通过了 GitHub 上的 R-CMD-check）：

parallel::clusterExport(cl = cl, 
                        unclass(lsf.str(envir = asNamespace("my_package"), 
                                        all = T)),
                        envir = as.environment(asNamespace("my_package"))
                        )

希望对其他人有用。

也可能通过globals package 提供了一个漂亮的解决方案，但我无法通过对 GitHub 操作的检查。