[英]Kaplan meier survival curve is flipped in R?
我在数据上拟合了 KM 生存 model 和 model 的摘要似乎很好,但是每当我 plot 它在第 2 天的 00 和第 2 天左右的 0 时反转
kaplan <- survfit(Surv(time_diff, death)~1, data = new_data)
summary(kaplan)
时间 | n.风险 | n.事件 | P((s0)) | P(1) |
---|---|---|---|---|
6 | 84 | 1 | 0.9881 | 0.0119 |
7 | 83 | 1 | 0.9762 | 0.0238 |
11 | 79 | 1 | 0.9638 | 0.0362 |
13 | 78 | 1 | 0.9515 | 0.0485 |
18 | 74 | 1 | 0.9386 | 0.0614 |
19 | 73 | 1 | 0.9258 | 0.0742 |
20 | 72 | 1 | 0.9129 | 0.0871 |
21 | 71 | 1 | 0.9000 | 0.1000 |
24 | 68 | 1 | 0.8868 | 0.1132 |
26 | 67 | 2 | 0.8603 | 0.1397 |
29 | 64 | 1 | 0.8469 | 0.1531 |
33 | 62 | 1 | 0.8332 | 0.1668 |
47 | 57 | 1 | 0.8186 | 0.1814 |
56 | 54 | 1 | 0.8035 | 0.1965 |
63 | 53 | 1 | 0.7883 | 0.2117 |
64 | 52 | 1 | 0.7731 | 0.2269 |
75 | 50 | 1 | 0.7577 | 0.2423 |
85 | 47 | 1 | 0.7416 | 0.2584 |
96 | 46 | 1 | 0.7254 | 0.2746 |
117 | 45 | 1 | 0.7093 | 0.2907 |
133 | 44 | 1 | 0.6932 | 0.3068 |
138 | 42 | 1 | 0.6767 | 0.3233 |
139 | 41 | 1 | 0.6602 | 0.3398 |
144 | 40 | 1 | 0.6437 | 0.3563 |
170 | 37 | 1 | 0.6263 | 0.3737 |
180 | 36 | 1 | 0.6089 | 0.3911 |
189 | 35 | 1 | 0.5915 | 0.4085 |
192 | 34 | 1 | 0.5741 | 0.4259 |
210 | 33 | 1 | 0.5567 | 0.4433 |
225 | 32 | 1 | 0.5393 | 0.4607 |
253 | 30 | 1 | 0.5213 | 0.4787 |
258 | 29 | 1 | 0.5033 | 0.4967 |
269 | 28 | 1 | 0.4854 | 0.5146 |
548 | 19 | 1 | 0.4598 | 0.5402 |
603 | 17 | 1 | 0.4328 | 0.5672 |
1078 | 11 | 1 | 0.3934 | 0.6066 |
1263 | 10 | 1 | 0.3541 | 0.6459 |
1388 | 8 | 1 | 0.3098 | 0.6902 |
1466 | 7 | 1 | 0.2656 | 0.7344 |
2060 | 5 | 1 | 0.2125 | 0.7875 |
2097 | 4 | 1 | 0.1593 | 0.8407 |
2281 | 3 | 1 | 0.1062 | 0.8938 |
2460 | 2 | 1 | 0.0531 | 0.9469 |
2828 | 1 | 1 | 0.0000 | 1.0000 |
plot(kaplan)
对不起,如果问题很简单,因为我是新 R!
非常感谢!
可能您的状态变量death
是一个因素。 不应该。 它应该是数字。
在下面运行一个玩具示例。 在这里, status
是一个因素,所以 plot 看起来像你的:
time<-1:10
status<-factor(rep(1:0, 5)) # factor!
fit<-survfit(Surv(time, status)~1)
plot(fit)
现在, status
是数字,plot 看起来像您希望的样子。
time<-1:10
status<-rep(1:0, 5) # numeric!
fit<-survfit(Surv(time, status)~1)
plot(fit)
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